28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3848 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3848  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  313  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0157  hypothetical protein  90 
 
 		 160 aa  289  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  53.37 
 
 		 164 aa  165  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3826  hypothetical protein  58.45 
 
 		 171 aa  160  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492638 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  41.55 
 
 		 173 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  41.51 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  33.96 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  35.85 
 
 		 180 aa  104  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  40.71 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2265  membrane protein-like protein  41.33 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.560629  normal  0.0217418 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  39.44 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3895  hypothetical protein  37.11 
 
 		 186 aa  90.1  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  38.97 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  34.27 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  30.2 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  33.09 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  33.81 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  36.43 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  33.79 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  32.09 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  35.04 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  34.78 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  34.44 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  34.31 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4757  hypothetical protein  33.06 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13862  normal  0.0394716 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  28.37 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  30.34 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  28.99 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>