51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4131 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  100 
 
 		 165 aa  325  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  53.8 
 
 		 162 aa  161  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  46.3 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  50.98 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  47.88 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  36.3 
 
 		 175 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  34.44 
 
 		 195 aa  86.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  34.21 
 
 		 270 aa  85.9  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  37.06 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  34.16 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  36.99 
 
 		 185 aa  80.5  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  32.87 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  36.3 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  36.3 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  33.13 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  36.05 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  31.03 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  38.73 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  32.41 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  30.07 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.09 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  33.1 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2265  membrane protein-like protein  35.21 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.560629  normal  0.0217418 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  30.87 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  34.78 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3826  hypothetical protein  31.94 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.23 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  28.57 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0157  hypothetical protein  29.45 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.21 
 
 		 296 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  25.53 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  33.07 
 
 		 315 aa  52.4  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3848  hypothetical protein  30.34 
 
 		 160 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  37.23 
 
 		 285 aa  51.6  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.3 
 
 		 289 aa  51.6  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  31.16 
 
 		 185 aa  51.2  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0260  hypothetical protein  31.11 
 
 		 189 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.075822  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0270  hypothetical protein  31.11 
 
 		 189 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  31.11 
 
 		 189 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20170  hypothetical protein  31.31 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.0396109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  26.95 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  31.21 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  30.5 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2772  hypothetical protein  31.03 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.94 
 
 		 294 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.48 
 
 		 293 aa  44.3  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2830  hypothetical protein  28.28 
 
 		 146 aa  44.3  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000108966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  27.78 
 
 		 189 aa  44.3  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0799  hypothetical protein  24.29 
 
 		 161 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0593  hypothetical protein  29.93 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.650029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0232  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.21 
 
 		 303 aa  40.8  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>