143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4736 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  100 
 
 
293 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.61 
 
 
296 aa  223  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  41.24 
 
 
315 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0232  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.7 
 
 
303 aa  200  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0333  Rieske (2Fe-2S) protein  43.2 
 
 
298 aa  185  9e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  42.61 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.9 
 
 
304 aa  183  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0513  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  42.35 
 
 
303 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.53 
 
 
294 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.76 
 
 
289 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.2 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.89 
 
 
322 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  35.5 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  40.96 
 
 
189 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  44.8 
 
 
221 aa  94.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.89 
 
 
277 aa  92.4  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20170  hypothetical protein  37.18 
 
 
176 aa  87  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.0396109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0260  hypothetical protein  32.93 
 
 
189 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.075822  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0270  hypothetical protein  32.93 
 
 
189 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  32.93 
 
 
189 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02690  hypothetical protein  39.44 
 
 
224 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1579  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  33.54 
 
 
189 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  28.63 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1112  hypothetical protein  35.67 
 
 
195 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.900973  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1038  hypothetical protein  34.64 
 
 
180 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  39.24 
 
 
102 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2066  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  41.77 
 
 
121 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.62 
 
 
526 aa  59.3  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0205  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35.78 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0981  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35.78 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1380  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  35.78 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1577  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  35.78 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869936  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2705  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  35.78 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2561  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  35.78 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0236  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  35.78 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0662  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.63 
 
 
506 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  32.38 
 
 
289 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0570  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.27 
 
 
506 aa  55.8  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0198905  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3120  pyruvate oxidase  34.86 
 
 
656 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.777401  normal  0.194873 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1119  anthranilate dioxygenase ferredoxin subunit(AndAb)  35.24 
 
 
107 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1258  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.21 
 
 
119 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0240354  hitchhiker  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4955  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.46 
 
 
108 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519732  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00540  hypothetical protein  45.88 
 
 
111 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0490  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35.92 
 
 
109 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5152  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.02 
 
 
108 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2323  Rieske (2Fe-2S) protein  30.7 
 
 
108 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1110  anthranilate dioxygenase ferredoxin reductase(AndAb)  35.24 
 
 
107 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662253  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5504  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.58 
 
 
108 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.124598  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4586  Rieske (2Fe-2S) region  30.7 
 
 
108 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312616  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3777  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.7 
 
 
108 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.872692  normal  0.412492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3746  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.7 
 
 
108 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108566  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3669  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.58 
 
 
108 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.738821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  35.06 
 
 
185 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  35.06 
 
 
185 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.74 
 
 
114 aa  52.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000457155  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
521 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3123  Rieske (2Fe-2S) protein  28.44 
 
 
349 aa  52.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00337014  normal  0.164048 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.63 
 
 
105 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5985  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  35.29 
 
 
105 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  32.94 
 
 
185 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0311  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.14 
 
 
105 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1668  assimilatory nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  34.55 
 
 
113 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0880692  normal  0.298986 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2675  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.86 
 
 
506 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148641  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  31.48 
 
 
106 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.57 
 
 
107 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.14 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2541  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.86 
 
 
506 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.61 
 
 
136 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.74 
 
 
106 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.02 
 
 
523 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3175  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.86 
 
 
506 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759164  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4349  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.64 
 
 
516 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504096  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.66 
 
 
513 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0406  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.67 
 
 
103 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3220  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.5 
 
 
508 aa  49.7  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  37.11 
 
 
171 aa  50.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3044  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  34.29 
 
 
109 aa  49.7  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.109666  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.85 
 
 
286 aa  49.7  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  30 
 
 
175 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.07 
 
 
101 aa  48.5  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2961  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  31.25 
 
 
111 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  31.68 
 
 
119 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1970  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.8 
 
 
109 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  31.78 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  30.19 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.56 
 
 
166 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  32.28 
 
 
162 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0955  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.18 
 
 
112 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  29.92 
 
 
165 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  36.63 
 
 
110 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2444  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.26 
 
 
117 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44307  normal  0.0794581 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  30.28 
 
 
106 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2964  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  34.78 
 
 
112 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5395  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.36 
 
 
105 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.58 
 
 
509 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2526  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.25 
 
 
350 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672374  normal  0.0193911 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01479  dioxygenase, ferredoxin reductase component, putative  30.77 
 
 
559 aa  46.2  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1397  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.67 
 
 
509 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6432  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.67 
 
 
509 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6409  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.65 
 
 
512 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971185  normal  0.172531 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>