46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3979 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  309  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  91.36 
 
 		 168 aa  268  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  46.3 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  49.04 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  44.59 
 
 		 175 aa  120  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  41.26 
 
 		 185 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  40.56 
 
 		 185 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  40.56 
 
 		 185 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  39.24 
 
 		 153 aa  89  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  37.82 
 
 		 170 aa  87  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  31.51 
 
 		 270 aa  80.9  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  35.66 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  42.25 
 
 		 173 aa  77  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  32.34 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  35.92 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  31.47 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3826  hypothetical protein  34.03 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492638 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.16 
 
 		 277 aa  72  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  31.25 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  33.56 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  29.08 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  36.3 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3848  hypothetical protein  35.04 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  28.37 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0157  hypothetical protein  31.85 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2265  membrane protein-like protein  35.21 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.560629  normal  0.0217418 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  33.55 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  30.72 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  31.21 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  29.45 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0799  hypothetical protein  25.5 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  28.08 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28 
 
 		 289 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  33.33 
 
 		 315 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  34.06 
 
 		 189 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.99 
 
 		 296 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  28.87 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3662  hypothetical protein  30.37 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.11 
 
 		 322 aa  47.4  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0593  hypothetical protein  28.47 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.650029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.71 
 
 		 294 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  37.78 
 
 		 285 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0983  hypothetical protein  37.5 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.328819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3895  hypothetical protein  33.8 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4296  hypothetical protein  29.23 
 
 		 166 aa  41.2  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00940496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1825  hypothetical protein  31.94 
 
 		 217 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>