39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6294 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  318  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  53.8 
 
 		 165 aa  161  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  51.66 
 
 		 175 aa  147  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  49.04 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  46.95 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  39.44 
 
 		 185 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  41.18 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  38.73 
 
 		 185 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  38.73 
 
 		 185 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  38.06 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  37.24 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  38.67 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  37.68 
 
 		 175 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  36.55 
 
 		 270 aa  71.2  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  31.47 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  33.79 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  40.14 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  33.58 
 
 		 180 aa  62  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  33.78 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.61 
 
 		 289 aa  53.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  29.29 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  26.62 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  30.61 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  27.86 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  29.32 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02690  hypothetical protein  33.67 
 
 		 224 aa  47.8  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  39.18 
 
 		 285 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  33.09 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  34.31 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.81 
 
 		 294 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  30.07 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  28.19 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.19 
 
 		 296 aa  43.9  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0157  hypothetical protein  29.71 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2265  membrane protein-like protein  35.17 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.560629  normal  0.0217418 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3848  hypothetical protein  28.99 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.98 
 
 		 293 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20170  hypothetical protein  26.73 
 
 		 176 aa  40.4  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.0396109 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0593  hypothetical protein  25.19 
 
 		 143 aa  40.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.650029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>