44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1782 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  289  7e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  96.03 
 
 		 151 aa  256  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  45.7 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4757  hypothetical protein  43.8 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13862  normal  0.0394716 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  41.84 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  41.96 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  40.69 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  39.72 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  42.14 
 
 		 195 aa  103  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5607  hypothetical protein  48.67 
 
 		 145 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835416 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  37.86 
 
 		 173 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  35.46 
 
 		 180 aa  99.4  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  41.72 
 
 		 170 aa  83.6  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3848  hypothetical protein  33.79 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0157  hypothetical protein  32.86 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  32.89 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3895  hypothetical protein  35.46 
 
 		 186 aa  70.5  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3826  hypothetical protein  31.47 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492638 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  29.33 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2265  membrane protein-like protein  35 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.560629  normal  0.0217418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  32.35 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3614  hypothetical protein  31.62 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.66214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2828  hypothetical protein  32.31 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1955  hypothetical protein  32.52 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220825  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3111  hypothetical protein  32.8 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1786  hypothetical protein  31.54 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.913708  hitchhiker  0.00540789 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  34.31 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  31.21 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0782  succinate dehydrogenase cytochrome b subunit family protein  35.38 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3788  hypothetical protein  35.65 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  33.1 
 
 		 185 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  33.1 
 
 		 185 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  33.1 
 
 		 185 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3688  hypothetical protein  31.16 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292524  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2301  hypothetical protein  33.08 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576316  normal  0.759333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2844  hypothetical protein  31.93 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  31.94 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  31.72 
 
 		 270 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33460  hypothetical protein  30.25 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24564  normal  0.0632738 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.78 
 
 		 277 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  27.27 
 
 		 173 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  26.43 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>