18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2844 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2844  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  271  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33460  hypothetical protein  95.04 
 
 		 141 aa  217  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24564  normal  0.0632738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3788  hypothetical protein  55.56 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  38.98 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1786  hypothetical protein  40.4 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.913708  hitchhiker  0.00540789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2828  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3688  hypothetical protein  43.33 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292524  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0782  succinate dehydrogenase cytochrome b subunit family protein  35.71 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1955  hypothetical protein  36.07 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220825  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4757  hypothetical protein  34.59 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13862  normal  0.0394716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  31.45 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  29.84 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3111  hypothetical protein  36 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3614  hypothetical protein  36 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.66214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5607  hypothetical protein  32.8 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2301  hypothetical protein  36.19 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576316  normal  0.759333 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  27.1 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  23.36 
 
 		 173 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>