19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3788 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3788  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  284  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33460  hypothetical protein  55.05 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24564  normal  0.0632738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2844  hypothetical protein  54.13 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  37.6 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2828  hypothetical protein  37.62 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1786  hypothetical protein  38.78 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.913708  hitchhiker  0.00540789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3614  hypothetical protein  35.16 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.66214  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3688  hypothetical protein  38.64 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292524  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  34.75 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  34.75 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3111  hypothetical protein  38.24 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1955  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220825  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4757  hypothetical protein  34.19 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13862  normal  0.0394716 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0782  succinate dehydrogenase cytochrome b subunit family protein  32.63 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  26.02 
 
 		 195 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2301  hypothetical protein  35.04 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576316  normal  0.759333 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  30.51 
 
 		 159 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5607  hypothetical protein  32.73 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835416 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  26.72 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>