42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3895 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3895  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  78.49 
 
 
180 aa  296  8e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  62.13 
 
 
173 aa  220  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  59.28 
 
 
173 aa  210  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  51.35 
 
 
159 aa  160  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  43.62 
 
 
175 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  40.13 
 
 
165 aa  123  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  42.47 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  38.78 
 
 
154 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0157  hypothetical protein  41.51 
 
 
160 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486831  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3826  hypothetical protein  36.31 
 
 
171 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.492638 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  38.56 
 
 
164 aa  108  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  39.86 
 
 
156 aa  104  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  39.29 
 
 
153 aa  104  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3848  hypothetical protein  37.11 
 
 
160 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  39.58 
 
 
170 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2265  membrane protein-like protein  41.22 
 
 
152 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.560629  normal  0.0217418 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  36.17 
 
 
151 aa  89  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  35.46 
 
 
151 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4757  hypothetical protein  30.66 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13862  normal  0.0394716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  32.03 
 
 
153 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  32.61 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  33.8 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  35.77 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  31.88 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  31.88 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  34.81 
 
 
189 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  30.07 
 
 
165 aa  62.4  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  35.04 
 
 
162 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  32.67 
 
 
171 aa  57.8  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  32.19 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5607  hypothetical protein  30.58 
 
 
145 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835416 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  32.19 
 
 
270 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2828  hypothetical protein  29.79 
 
 
142 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  31.69 
 
 
168 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5656  hypothetical protein  39.53 
 
 
102 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.74 
 
 
277 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1302  hypothetical protein  28.3 
 
 
289 aa  42.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  28.38 
 
 
185 aa  42.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  29.37 
 
 
221 aa  42.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1786  hypothetical protein  28.93 
 
 
142 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.913708  hitchhiker  0.00540789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.18 
 
 
296 aa  42  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>