40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2265 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2265  membrane protein-like protein  100 
 
 		 152 aa  294  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.560629  normal  0.0217418 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  69.59 
 
 		 165 aa  203  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  46.94 
 
 		 156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  48.59 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  42.96 
 
 		 180 aa  124  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  40.85 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  42.36 
 
 		 175 aa  114  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0157  hypothetical protein  43.57 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  38.51 
 
 		 173 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  43.45 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3848  hypothetical protein  41.33 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  40.54 
 
 		 195 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3826  hypothetical protein  40 
 
 		 171 aa  103  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492638 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  43.36 
 
 		 170 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  36.81 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3895  hypothetical protein  41.22 
 
 		 186 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  37.06 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  36.76 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  37.14 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  35.21 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  35 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  35.21 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  30.28 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  32.61 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  32.61 
 
 		 185 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  32.61 
 
 		 185 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  35.21 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 277 aa  57.4  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  35.86 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  29.86 
 
 		 270 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2059  hypothetical protein  31.39 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123784  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4757  hypothetical protein  29.46 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13862  normal  0.0394716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.15 
 
 		 296 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  30.56 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5607  hypothetical protein  30.16 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835416 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  27.59 
 
 		 189 aa  44.3  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  30.83 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  28.15 
 
 		 315 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  27.66 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.37 
 
 		 289 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>