28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2570 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  100 
 
 
185 aa  377  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  35.21 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  33.55 
 
 
162 aa  61.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  33.33 
 
 
175 aa  57.8  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  30.71 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  34.27 
 
 
153 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  27.94 
 
 
195 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3848  hypothetical protein  28.37 
 
 
160 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  31.16 
 
 
165 aa  51.2  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0157  hypothetical protein  28.47 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486831  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  32.39 
 
 
185 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  27.86 
 
 
162 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  26.03 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  32.39 
 
 
185 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  32.39 
 
 
185 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  29.41 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  31.94 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  29.29 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  28.99 
 
 
159 aa  45.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  25.55 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  28.67 
 
 
180 aa  45.1  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.16 
 
 
296 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.23 
 
 
289 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  27.92 
 
 
170 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3826  hypothetical protein  28.17 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.492638 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2059  hypothetical protein  32.62 
 
 
147 aa  42.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123784  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.47 
 
 
277 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  24.49 
 
 
270 aa  42  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>