49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0258 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  298  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  42.66 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  50.35 
 
 
159 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  45 
 
 
173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  44.29 
 
 
173 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  46.36 
 
 
151 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  45.7 
 
 
151 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  45.14 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4757  hypothetical protein  43.88 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13862  normal  0.0394716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  38.62 
 
 
175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  36.43 
 
 
180 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  37.09 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5607  hypothetical protein  47.06 
 
 
145 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835416 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  38.62 
 
 
170 aa  87.8  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3848  hypothetical protein  33.09 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2265  membrane protein-like protein  37.06 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.560629  normal  0.0217418 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3895  hypothetical protein  39.29 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0157  hypothetical protein  29.68 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486831  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1786  hypothetical protein  37.01 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.913708  hitchhiker  0.00540789 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1955  hypothetical protein  35.82 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220825  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  32.41 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2828  hypothetical protein  31.43 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  32.19 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3826  hypothetical protein  34.01 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.492638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3614  hypothetical protein  33.81 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.66214  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  34.81 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2301  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576316  normal  0.759333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3111  hypothetical protein  34.62 
 
 
131 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3688  hypothetical protein  35.82 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292524  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0782  succinate dehydrogenase cytochrome b subunit family protein  32.14 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  31.51 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  33.79 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  36.3 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  29.86 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  29.66 
 
 
270 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3788  hypothetical protein  37.6 
 
 
146 aa  57.8  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15952  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  37.24 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  34.27 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2844  hypothetical protein  36.7 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33460  hypothetical protein  36.7 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24564  normal  0.0632738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  30.07 
 
 
185 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  30.07 
 
 
185 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  30.07 
 
 
185 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  36.3 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.21 
 
 
277 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  25.69 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  27.12 
 
 
315 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  29.08 
 
 
189 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.81 
 
 
296 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>