37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_11160 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  325  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2265  membrane protein-like protein  69.59 
 
 		 152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.560629  normal  0.0217418 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  47.65 
 
 		 156 aa  133  9e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  42.04 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  45.21 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  38.85 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  38.22 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0157  hypothetical protein  40.88 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3848  hypothetical protein  41.51 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  40.52 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  39.72 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  41.84 
 
 		 195 aa  107  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  39.01 
 
 		 175 aa  104  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3826  hypothetical protein  40.27 
 
 		 171 aa  101  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492638 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  37.09 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  40.71 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3895  hypothetical protein  40.13 
 
 		 186 aa  94.4  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  37.16 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  38.1 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  33.56 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  32.59 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  30.87 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  31.21 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  31.21 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  31.21 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  29.5 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  27.08 
 
 		 270 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  34.23 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4757  hypothetical protein  32.79 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13862  normal  0.0394716 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5607  hypothetical protein  30.95 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835416 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  29.29 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  28.19 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  30.6 
 
 		 315 aa  45.1  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.61 
 
 		 296 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2830  hypothetical protein  31.25 
 
 		 146 aa  43.9  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000108966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  30.19 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2059  hypothetical protein  31.39 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>