22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3688 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3688  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1786  hypothetical protein  92.96 
 
 		 142 aa  267  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.913708  hitchhiker  0.00540789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2828  hypothetical protein  78.72 
 
 		 142 aa  233  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3614  hypothetical protein  78.57 
 
 		 142 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.66214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3111  hypothetical protein  81.25 
 
 		 131 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2301  hypothetical protein  78.72 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576316  normal  0.759333 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1955  hypothetical protein  65.96 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220825  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0782  succinate dehydrogenase cytochrome b subunit family protein  58.39 
 
 		 141 aa  157  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  35.82 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4757  hypothetical protein  38.28 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13862  normal  0.0394716 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5607  hypothetical protein  37.69 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835416 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33460  hypothetical protein  39.8 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24564  normal  0.0632738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2844  hypothetical protein  39.8 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  31.54 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  31.54 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3788  hypothetical protein  38.71 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  26.45 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  27.56 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  31.25 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  33.98 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  30.47 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  30.16 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>