27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3826 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3826  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  343  7e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492638 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0157  hypothetical protein  57.75 
 
 		 160 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3848  hypothetical protein  58.45 
 
 		 160 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  46.5 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  38.89 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  34.12 
 
 		 180 aa  117  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  37.75 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  40.27 
 
 		 165 aa  101  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2265  membrane protein-like protein  40 
 
 		 152 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.560629  normal  0.0217418 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3895  hypothetical protein  36.08 
 
 		 186 aa  92.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  32.64 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  31.51 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  34.03 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  31.21 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  33.1 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  31.08 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  34.01 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  34.75 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  32.88 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  31.47 
 
 		 151 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4757  hypothetical protein  32.74 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13862  normal  0.0394716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  28.36 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  31.47 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  31.94 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  29.5 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  28.17 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>