52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2820 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  100 
 
 		 175 aa  334  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  51.66 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  50.98 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  44.59 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  44.59 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  41.48 
 
 		 153 aa  91.3  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  42.34 
 
 		 159 aa  90.9  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  39.35 
 
 		 185 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  38.71 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  38.71 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  35.56 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  37.68 
 
 		 195 aa  80.9  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  35.33 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  33.33 
 
 		 270 aa  74.3  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  29.14 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  41.96 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  38.85 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  34.81 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3826  hypothetical protein  34.75 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2265  membrane protein-like protein  36.76 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.560629  normal  0.0217418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  28.99 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  32.59 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3848  hypothetical protein  32.09 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.57 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0157  hypothetical protein  31.34 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.37 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  29.2 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.56 
 
 		 289 aa  58.2  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  30.77 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  33.33 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  28.41 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  31.34 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  32.35 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  38.54 
 
 		 285 aa  54.7  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  32.35 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4757  hypothetical protein  32.81 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13862  normal  0.0394716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  30.66 
 
 		 189 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0593  hypothetical protein  29.79 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.650029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0232  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.71 
 
 		 303 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.68 
 
 		 322 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.94 
 
 		 294 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.51 
 
 		 304 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2059  hypothetical protein  35.29 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123784  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3895  hypothetical protein  35.77 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.92 
 
 		 293 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5607  hypothetical protein  35.59 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02690  hypothetical protein  28.42 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  28.12 
 
 		 315 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20170  hypothetical protein  31.58 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.0396109 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0799  hypothetical protein  23.57 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  29.68 
 
 		 189 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.960554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>