40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0250 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0260  hypothetical protein  99.47 
 
 
189 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.075822  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0270  hypothetical protein  99.47 
 
 
189 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  58.72 
 
 
189 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  36.13 
 
 
315 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20170  hypothetical protein  40.12 
 
 
176 aa  109  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.0396109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.75 
 
 
296 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  40.99 
 
 
189 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0232  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.51 
 
 
303 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.4 
 
 
294 aa  98.2  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.39 
 
 
322 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  40.48 
 
 
285 aa  95.9  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.8 
 
 
304 aa  89.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.93 
 
 
293 aa  88.2  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1112  hypothetical protein  31.48 
 
 
195 aa  84.7  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.900973  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  36.13 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02690  hypothetical protein  37.86 
 
 
224 aa  77.8  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1579  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1038  hypothetical protein  35.47 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.14 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.12 
 
 
294 aa  71.6  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0513  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  35.65 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0333  Rieske (2Fe-2S) protein  32.54 
 
 
298 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  33.33 
 
 
165 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  32.85 
 
 
185 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  32.85 
 
 
185 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  32.85 
 
 
185 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.67 
 
 
277 aa  53.9  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  32.06 
 
 
153 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  29.68 
 
 
175 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  28.48 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  31.43 
 
 
162 aa  52  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  27.96 
 
 
292 aa  52  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  28.47 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  32.85 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  31.16 
 
 
270 aa  48.5  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  29.86 
 
 
173 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  30.71 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  29.63 
 
 
159 aa  45.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  30 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2059  hypothetical protein  27.74 
 
 
147 aa  42.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>