297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4823 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  100 
 
 
285 aa  558  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  51.21 
 
 
315 aa  299  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.76 
 
 
296 aa  235  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0333  Rieske (2Fe-2S) protein  47.69 
 
 
298 aa  211  9e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0232  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.99 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  42.96 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.48 
 
 
304 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0513  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  42.16 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.86 
 
 
289 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.25 
 
 
294 aa  155  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.93 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.37 
 
 
322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  40.48 
 
 
189 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0260  hypothetical protein  40.48 
 
 
189 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.075822  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0270  hypothetical protein  40.48 
 
 
189 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  33.22 
 
 
292 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  39.13 
 
 
189 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  41.94 
 
 
221 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  37.06 
 
 
189 aa  99  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  29.26 
 
 
270 aa  92  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1112  hypothetical protein  39.39 
 
 
195 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.900973  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.33 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02690  hypothetical protein  40.26 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1579  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1038  hypothetical protein  37.74 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20170  hypothetical protein  32.53 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.0396109 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1987  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37 
 
 
108 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.78 
 
 
521 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2693  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.47 
 
 
506 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563055  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6409  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.47 
 
 
512 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971185  normal  0.172531 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5661  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.47 
 
 
512 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2734  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.32 
 
 
102 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0205  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.65 
 
 
109 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35 
 
 
504 aa  61.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0570  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.89 
 
 
506 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0198905  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0981  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.65 
 
 
109 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0236  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  34.65 
 
 
109 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6009  Rieske (2Fe-2S) protein  32.32 
 
 
102 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2710  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.32 
 
 
102 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.332301  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0490  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35.64 
 
 
109 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1577  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  34.65 
 
 
109 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869936  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2070  MocE Rieske (2Fe-2S)  32.32 
 
 
102 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143591  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2681  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.32 
 
 
102 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2705  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  34.65 
 
 
109 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1380  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  34.65 
 
 
109 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2561  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  34.65 
 
 
109 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  34.69 
 
 
106 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.21 
 
 
158 aa  59.7  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.59 
 
 
107 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0662  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.78 
 
 
506 aa  59.7  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2675  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.1 
 
 
506 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148641  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  34.04 
 
 
165 aa  59.3  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1662  Rieske (2Fe-2S) protein  33.65 
 
 
125 aa  58.9  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3175  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.37 
 
 
506 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759164  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2541  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.76 
 
 
506 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.67 
 
 
509 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  35.64 
 
 
171 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5421  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.47 
 
 
508 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.71 
 
 
523 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4955  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.34 
 
 
108 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519732  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  34.88 
 
 
599 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0392  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.62 
 
 
105 aa  57.4  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.333878  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35 
 
 
114 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000457155  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3123  Rieske (2Fe-2S) protein  50 
 
 
349 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00337014  normal  0.164048 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  32.72 
 
 
175 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  34 
 
 
102 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3669  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
108 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.738821 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7008  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.73 
 
 
527 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144463  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1397  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.73 
 
 
509 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4349  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.1 
 
 
516 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504096  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6432  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.73 
 
 
509 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  35.35 
 
 
106 aa  56.2  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3746  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
108 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108566  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  40.23 
 
 
521 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.78 
 
 
352 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  33.66 
 
 
289 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4586  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 
108 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312616  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5504  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
108 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.124598  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3777  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
108 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.872692  normal  0.412492 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.73 
 
 
509 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194312 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3220  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.39 
 
 
508 aa  55.8  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  31.82 
 
 
185 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  31.82 
 
 
185 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1119  anthranilate dioxygenase ferredoxin subunit(AndAb)  33 
 
 
107 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2526  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.6 
 
 
350 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672374  normal  0.0193911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.3 
 
 
513 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2323  Rieske (2Fe-2S) protein  33.33 
 
 
108 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1739  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.24 
 
 
101 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  31.82 
 
 
185 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.38 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6044  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  46.55 
 
 
141 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  32.32 
 
 
119 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09103  apoptosis-inducing factor (Eurofung)  32.08 
 
 
561 aa  53.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0266985  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1235  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.02 
 
 
349 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0616  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.3 
 
 
102 aa  53.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2964  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  38.1 
 
 
112 aa  52.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3462  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.69 
 
 
116 aa  52.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  35.16 
 
 
162 aa  52.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.1 
 
 
341 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.65 
 
 
106 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5285  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.75 
 
 
521 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>