41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2915 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  310  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  46.81 
 
 
159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  41.45 
 
 
173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  42.66 
 
 
153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  45 
 
 
173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  48.2 
 
 
195 aa  130  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  41.61 
 
 
175 aa  117  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  40.14 
 
 
180 aa  112  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  39.72 
 
 
165 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  41.84 
 
 
151 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  41.43 
 
 
151 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  38.03 
 
 
170 aa  94.4  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  33.11 
 
 
156 aa  89  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  34.01 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0157  hypothetical protein  33.78 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486831  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2265  membrane protein-like protein  36.43 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.560629  normal  0.0217418 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3895  hypothetical protein  40 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3848  hypothetical protein  34.27 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3826  hypothetical protein  31.51 
 
 
171 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.492638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  35.37 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  31.03 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4757  hypothetical protein  27.92 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13862  normal  0.0394716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  31.25 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  32.89 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5607  hypothetical protein  34.62 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835416 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  29.2 
 
 
175 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  32.26 
 
 
185 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  32.26 
 
 
185 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  32.26 
 
 
185 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  29.81 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  29.17 
 
 
168 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  26.62 
 
 
162 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  28.91 
 
 
315 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  25.87 
 
 
171 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.41 
 
 
277 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.1 
 
 
294 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  27.61 
 
 
189 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  28.68 
 
 
221 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1786  hypothetical protein  29.69 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.913708  hitchhiker  0.00540789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4155  hypothetical protein  29.7 
 
 
1004 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4195  hypothetical protein  29.7 
 
 
1004 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>