47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2153 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  300  6.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  45.58 
 
 		 185 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  45.58 
 
 		 185 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  45.58 
 
 		 185 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  36.94 
 
 		 170 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  41.48 
 
 		 175 aa  91.3  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  39.24 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  39.6 
 
 		 270 aa  88.2  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  36.36 
 
 		 195 aa  85.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  35 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  46.26 
 
 		 173 aa  84.3  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  33.8 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  34.16 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  32.86 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  37.24 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  32.03 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  37.34 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  29.41 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  35.21 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  36.81 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  32.89 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  29.86 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  31.79 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.25 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3826  hypothetical protein  28.36 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.41 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3848  hypothetical protein  34.78 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  29.5 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.15 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0157  hypothetical protein  32.61 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  29.79 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  30 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  28.67 
 
 		 189 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4757  hypothetical protein  27.33 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13862  normal  0.0394716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2265  membrane protein-like protein  29.37 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.560629  normal  0.0217418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20170  hypothetical protein  31 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.0396109 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  29.37 
 
 		 221 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5607  hypothetical protein  31.34 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3895  hypothetical protein  33.57 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  25.93 
 
 		 315 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0270  hypothetical protein  32.06 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0260  hypothetical protein  32.06 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.075822  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  32.06 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2059  hypothetical protein  30.83 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123784  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0593  hypothetical protein  26.81 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.650029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>