291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4533 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
294 aa  580  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  40.42 
 
 
315 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.2 
 
 
322 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.3 
 
 
289 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0232  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.04 
 
 
303 aa  166  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 
296 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  36.93 
 
 
285 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.65 
 
 
304 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0333  Rieske (2Fe-2S) protein  37.67 
 
 
298 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  39.15 
 
 
293 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  38.98 
 
 
292 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.35 
 
 
294 aa  122  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0513  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  35.46 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  41.55 
 
 
221 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02690  hypothetical protein  44.29 
 
 
224 aa  99.8  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1579  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1038  hypothetical protein  43.71 
 
 
180 aa  99  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  40 
 
 
189 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0260  hypothetical protein  42.04 
 
 
189 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.075822  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  42.04 
 
 
189 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0270  hypothetical protein  42.04 
 
 
189 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.37 
 
 
277 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1112  hypothetical protein  43.57 
 
 
195 aa  92  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.900973  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  33.72 
 
 
189 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  27.88 
 
 
270 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.22 
 
 
509 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5661  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.9 
 
 
512 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7008  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.25 
 
 
527 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144463  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  36.89 
 
 
106 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6409  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.9 
 
 
512 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971185  normal  0.172531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  38.83 
 
 
106 aa  70.1  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1397  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.78 
 
 
509 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6432  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.78 
 
 
509 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  34.39 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  34.39 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20170  hypothetical protein  33.73 
 
 
176 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.0396109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  33.76 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  39.8 
 
 
110 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.68 
 
 
137 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03310  conserved hypothetical protein  31.13 
 
 
585 aa  67.4  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0173  Rieske (2Fe-2S) region  34 
 
 
104 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7057  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34 
 
 
104 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250016  normal  0.403256 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09103  apoptosis-inducing factor (Eurofung)  32.38 
 
 
561 aa  66.6  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0266985  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2693  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.04 
 
 
506 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563055  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  35.1 
 
 
171 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0570  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.71 
 
 
506 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0198905  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5421  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.63 
 
 
508 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0662  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 
506 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2675  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.89 
 
 
506 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148641  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.61 
 
 
504 aa  63.9  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00540  hypothetical protein  48.31 
 
 
111 aa  63.9  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.78 
 
 
526 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.1 
 
 
521 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2961  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  38.38 
 
 
111 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2541  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.19 
 
 
506 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3175  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.04 
 
 
506 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759164  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.46 
 
 
114 aa  62.4  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000457155  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3123  Rieske (2Fe-2S) protein  32.5 
 
 
349 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00337014  normal  0.164048 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1503  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  32.67 
 
 
105 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.64 
 
 
112 aa  60.8  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  35.92 
 
 
521 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2734  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.69 
 
 
102 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1662  Rieske (2Fe-2S) protein  38.78 
 
 
125 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1305  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.68 
 
 
105 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.935545  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0321  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  31.68 
 
 
105 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.23021  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1338  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  31.68 
 
 
105 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872244  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2492  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.68 
 
 
105 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0970  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  31.68 
 
 
105 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0597  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  31.68 
 
 
105 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0893389  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1232  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.68 
 
 
105 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.68 
 
 
105 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587987 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3220  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.08 
 
 
508 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102574 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3656  Rieske (2Fe-2S) region  31.68 
 
 
105 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747877  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2265  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.69 
 
 
113 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4711  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.68 
 
 
105 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.938131  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  34.58 
 
 
238 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2135  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.65 
 
 
116 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.27 
 
 
118 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4570  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.68 
 
 
105 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0919723  hitchhiker  0.000210645 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1103  Rieske (2Fe-2S) protein  31.68 
 
 
105 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476425  normal  0.326175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4105  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.68 
 
 
105 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3982  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.68 
 
 
105 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0367029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1970  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.96 
 
 
109 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4231  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.68 
 
 
105 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.77 
 
 
509 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0616  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.73 
 
 
102 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.68 
 
 
518 aa  55.8  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2796  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.21 
 
 
108 aa  55.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6009  Rieske (2Fe-2S) protein  28.71 
 
 
102 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  31.65 
 
 
175 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  35.46 
 
 
162 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4349  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.24 
 
 
516 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504096  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.75 
 
 
106 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2070  MocE Rieske (2Fe-2S)  28.71 
 
 
102 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143591  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2681  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.71 
 
 
102 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2710  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.71 
 
 
102 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.332301  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  35.25 
 
 
162 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.76 
 
 
523 aa  53.9  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1258  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.79 
 
 
119 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0240354  hitchhiker  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.01 
 
 
99 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>