204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4812 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
304 aa  604  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0232  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.19 
 
 
303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0513  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  56.42 
 
 
303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.94 
 
 
296 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  43.97 
 
 
315 aa  235  7e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0333  Rieske (2Fe-2S) protein  50.54 
 
 
298 aa  230  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.52 
 
 
294 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  43.48 
 
 
285 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  41.9 
 
 
293 aa  185  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.65 
 
 
289 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
294 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.59 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  41.51 
 
 
189 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  35.96 
 
 
292 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02690  hypothetical protein  49.3 
 
 
224 aa  109  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1579  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1112  hypothetical protein  44.44 
 
 
195 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.900973  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  43.12 
 
 
221 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0260  hypothetical protein  35.8 
 
 
189 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.075822  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0270  hypothetical protein  35.8 
 
 
189 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  35.8 
 
 
189 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1038  hypothetical protein  43.29 
 
 
180 aa  99  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  31.15 
 
 
270 aa  95.9  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  34.18 
 
 
189 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20170  hypothetical protein  36.48 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.0396109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.82 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34 
 
 
526 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  33.98 
 
 
106 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  35.21 
 
 
175 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1143  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  42 
 
 
103 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  34.72 
 
 
185 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3123  Rieske (2Fe-2S) protein  39.13 
 
 
349 aa  59.7  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00337014  normal  0.164048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.16 
 
 
518 aa  59.3  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  34.72 
 
 
185 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  34.72 
 
 
185 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1397  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.7 
 
 
509 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6432  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.7 
 
 
509 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  30.63 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.68 
 
 
509 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2675  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.84 
 
 
506 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148641  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1987  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.35 
 
 
108 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3462  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.02 
 
 
116 aa  57  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.41 
 
 
105 aa  56.2  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2541  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.57 
 
 
506 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.7 
 
 
513 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2526  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.95 
 
 
350 aa  55.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672374  normal  0.0193911 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09103  apoptosis-inducing factor (Eurofung)  33.75 
 
 
561 aa  55.8  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0266985  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1258  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.67 
 
 
119 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0240354  hitchhiker  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5421  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.9 
 
 
508 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7008  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.7 
 
 
527 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144463  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6409  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
512 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971185  normal  0.172531 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  30.1 
 
 
106 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4349  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.77 
 
 
516 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504096  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5661  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
512 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1405  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  36.63 
 
 
140 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.82 
 
 
137 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3175  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.14 
 
 
506 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759164  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.68 
 
 
504 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2594  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  36.19 
 
 
140 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  29.63 
 
 
153 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.37 
 
 
521 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2848  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  35.24 
 
 
143 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3905  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.62 
 
 
114 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391138  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3529  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  36.63 
 
 
152 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719582  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1113  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  36.54 
 
 
120 aa  53.1  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2318  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  36 
 
 
127 aa  53.1  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125191  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.79 
 
 
107 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2679  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  36.73 
 
 
118 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.12 
 
 
523 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00540  hypothetical protein  47.62 
 
 
111 aa  52.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0205  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30 
 
 
109 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0981  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30 
 
 
109 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2558  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  36.36 
 
 
115 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1380  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  30 
 
 
109 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1577  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  30 
 
 
109 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869936  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2705  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  30 
 
 
109 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2561  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  30 
 
 
109 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0236  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  30 
 
 
109 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
106 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3160  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.63 
 
 
347 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2329  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  33.65 
 
 
129 aa  50.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3278  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  33.65 
 
 
128 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1001  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  32.35 
 
 
116 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  30.21 
 
 
102 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03310  conserved hypothetical protein  29.29 
 
 
585 aa  49.7  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  31.85 
 
 
162 aa  49.7  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2693  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.97 
 
 
506 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563055  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0992  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.56 
 
 
105 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  hitchhiker  0.00000000116756 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2308  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  34.34 
 
 
110 aa  49.3  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619497  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3650  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.96 
 
 
130 aa  49.3  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27405 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  32.32 
 
 
141 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  30.48 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0490  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.18 
 
 
109 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2106  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  37.62 
 
 
127 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298831  normal  0.595074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.16 
 
 
114 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000457155  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0591  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  40.85 
 
 
118 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0817  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  33 
 
 
103 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.78 
 
 
108 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  34.34 
 
 
171 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5395  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26 
 
 
105 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3220  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.12 
 
 
508 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>