17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0782 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0782  succinate dehydrogenase cytochrome b subunit family protein  100 
 
 
141 aa  278  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1786  hypothetical protein  58.65 
 
 
142 aa  156  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.913708  hitchhiker  0.00540789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2828  hypothetical protein  55.71 
 
 
142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3614  hypothetical protein  55 
 
 
142 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.66214  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3111  hypothetical protein  58.59 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1955  hypothetical protein  53.52 
 
 
142 aa  143  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220825  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3688  hypothetical protein  58.39 
 
 
142 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292524  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2301  hypothetical protein  56.83 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576316  normal  0.759333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  32.14 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4757  hypothetical protein  34.59 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13862  normal  0.0394716 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5607  hypothetical protein  33.08 
 
 
145 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835416 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  35.57 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  34.9 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2844  hypothetical protein  34.71 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33460  hypothetical protein  33.88 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24564  normal  0.0632738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3788  hypothetical protein  31.73 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15952  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  32.65 
 
 
170 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>