20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3111 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3111  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  253  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3614  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.66214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2828  hypothetical protein  85.38 
 
 		 142 aa  224  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1786  hypothetical protein  79.69 
 
 		 142 aa  210  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.913708  hitchhiker  0.00540789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2301  hypothetical protein  94.62 
 
 		 142 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576316  normal  0.759333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3688  hypothetical protein  81.25 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1955  hypothetical protein  72.22 
 
 		 142 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220825  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0782  succinate dehydrogenase cytochrome b subunit family protein  58.59 
 
 		 141 aa  156  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  34.62 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4757  hypothetical protein  34.68 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13862  normal  0.0394716 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  57  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5607  hypothetical protein  37.61 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835416 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3788  hypothetical protein  40.62 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  26.45 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  29.69 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33460  hypothetical protein  35.79 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24564  normal  0.0632738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2844  hypothetical protein  34.69 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  25.98 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  26.4 
 
 		 195 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>