18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1955 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1955  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220825  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2828  hypothetical protein  66.43 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1786  hypothetical protein  65.28 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.913708  hitchhiker  0.00540789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3688  hypothetical protein  65.25 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292524  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3111  hypothetical protein  72.22 
 
 		 131 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3614  hypothetical protein  72.22 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.66214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2301  hypothetical protein  66.43 
 
 		 142 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576316  normal  0.759333 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0782  succinate dehydrogenase cytochrome b subunit family protein  53.52 
 
 		 141 aa  143  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  35.82 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4757  hypothetical protein  34.45 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13862  normal  0.0394716 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5607  hypothetical protein  37.07 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835416 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2844  hypothetical protein  32.2 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33460  hypothetical protein  32.17 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24564  normal  0.0632738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3788  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  31.88 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  32.26 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  25.62 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  26.45 
 
 		 159 aa  40  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>