23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1825 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1825  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  422  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0799  hypothetical protein  28.4 
 
 
161 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2346  hypothetical protein  29.8 
 
 
175 aa  59.7  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4296  hypothetical protein  28.48 
 
 
166 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00940496  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3137  hypothetical protein  25.79 
 
 
166 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5320  hypothetical protein  25.74 
 
 
164 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0280  hypothetical protein  26.67 
 
 
166 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.769802  normal  0.0401474 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3662  hypothetical protein  25.56 
 
 
166 aa  53.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3104  hypothetical protein  28.87 
 
 
163 aa  52  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3579  hypothetical protein  25.17 
 
 
164 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0095214 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0983  hypothetical protein  32.31 
 
 
168 aa  49.7  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.328819  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  31.79 
 
 
162 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0181  hypothetical protein  24.84 
 
 
166 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  29.37 
 
 
185 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0200  hypothetical protein  23.38 
 
 
178 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22851  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  29.37 
 
 
185 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  29.37 
 
 
185 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  27.03 
 
 
175 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  28.09 
 
 
785 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  28.86 
 
 
153 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12611  hypothetical protein  24.81 
 
 
184 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.234249  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  32.84 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  30.66 
 
 
165 aa  41.6  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>