23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0200 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0200  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  357  5e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22851  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3662  hypothetical protein  44.81 
 
 
166 aa  148  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0280  hypothetical protein  44.16 
 
 
166 aa  142  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.769802  normal  0.0401474 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0983  hypothetical protein  45.45 
 
 
168 aa  139  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.328819  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4296  hypothetical protein  42.68 
 
 
166 aa  136  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00940496  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3137  hypothetical protein  42.21 
 
 
166 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3579  hypothetical protein  48.37 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0095214 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5320  hypothetical protein  48.05 
 
 
164 aa  129  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3104  hypothetical protein  40.91 
 
 
163 aa  127  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12611  hypothetical protein  41.4 
 
 
184 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.234249  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1740  hypothetical protein  40.12 
 
 
171 aa  124  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0181  hypothetical protein  43.23 
 
 
166 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0199  hypothetical protein  31.43 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.341144  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0279  hypothetical protein  24.18 
 
 
201 aa  63.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0414614 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0180  hypothetical protein  28.07 
 
 
201 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3578  hypothetical protein  29.94 
 
 
201 aa  61.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3661  hypothetical protein  26.32 
 
 
204 aa  58.9  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12621  hypothetical protein  25.27 
 
 
225 aa  58.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.194062  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4297  hypothetical protein  26.14 
 
 
201 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210784  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1739  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  55.1  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0982  hypothetical protein  29.5 
 
 
206 aa  54.7  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0957038  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3138  hypothetical protein  29.5 
 
 
198 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  27.34 
 
 
162 aa  40.8  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>