131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3441 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3441  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
599 aa  1191    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  69.26 
 
 
594 aa  816    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6175  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  71.19 
 
 
593 aa  831    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659991  hitchhiker  0.00257919 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1433  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  44.13 
 
 
604 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0662  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.22 
 
 
506 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01479  dioxygenase, ferredoxin reductase component, putative  37.5 
 
 
559 aa  63.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0570  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.53 
 
 
506 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0198905  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4522  Rieske (2Fe-2S) region  41.54 
 
 
116 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2693  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.65 
 
 
506 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563055  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.33 
 
 
521 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.34 
 
 
101 aa  58.9  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  35.37 
 
 
291 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.51 
 
 
289 aa  57.4  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1335  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.62 
 
 
116 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000656447 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1668  assimilatory nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  34.62 
 
 
113 aa  57  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0880692  normal  0.298986 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1307  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.62 
 
 
116 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2541  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.07 
 
 
506 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2675  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.07 
 
 
506 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148641  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3123  Rieske (2Fe-2S) protein  30.3 
 
 
349 aa  55.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00337014  normal  0.164048 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4335  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  32.71 
 
 
118 aa  55.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.29 
 
 
114 aa  55.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000457155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3175  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.97 
 
 
506 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759164  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  44.83 
 
 
521 aa  55.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.46 
 
 
112 aa  54.7  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.69 
 
 
106 aa  54.7  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.11 
 
 
118 aa  55.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.12 
 
 
649 aa  55.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  37.5 
 
 
98 aa  54.3  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3120  pyruvate oxidase  35.58 
 
 
656 aa  54.3  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.777401  normal  0.194873 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  35.05 
 
 
238 aa  54.3  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  35.05 
 
 
111 aa  54.3  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468725  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.38 
 
 
504 aa  54.3  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.71 
 
 
286 aa  53.9  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2815  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
107 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.717991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5690  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.8 
 
 
104 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  33.33 
 
 
103 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  42.31 
 
 
126 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1739  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.78 
 
 
101 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.29 
 
 
100 aa  52.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3443  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.85 
 
 
116 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  44.23 
 
 
285 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1452  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  32.29 
 
 
112 aa  51.6  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00226382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.99 
 
 
509 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  35.8 
 
 
356 aa  51.2  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2444  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.05 
 
 
117 aa  51.2  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44307  normal  0.0794581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.25 
 
 
100 aa  51.2  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.86 
 
 
322 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.71 
 
 
123 aa  51.2  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.38 
 
 
309 aa  50.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  36.92 
 
 
270 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  34.67 
 
 
315 aa  49.3  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0271  putative dioxygenase ferredoxin subunit  32.35 
 
 
102 aa  49.3  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1662  Rieske (2Fe-2S) protein  35.11 
 
 
125 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0780  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.12 
 
 
100 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.12357  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  32.5 
 
 
289 aa  49.3  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  39.58 
 
 
289 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1708  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  29.7 
 
 
113 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.78764  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5421  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.43 
 
 
508 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5285  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.71 
 
 
521 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  31.94 
 
 
599 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  30.56 
 
 
110 aa  48.5  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5661  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.71 
 
 
512 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.18 
 
 
158 aa  48.9  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.76 
 
 
171 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2955  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  31.31 
 
 
115 aa  48.9  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.55 
 
 
99 aa  48.9  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  25.61 
 
 
270 aa  48.5  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26520  predicted protein  36.67 
 
 
150 aa  48.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35 
 
 
294 aa  48.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1113  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  33 
 
 
120 aa  48.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4349  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.14 
 
 
516 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504096  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  28.85 
 
 
114 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383279  normal  0.78464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  38.46 
 
 
351 aa  48.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2961  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  34.74 
 
 
111 aa  48.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2526  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.33 
 
 
350 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672374  normal  0.0193911 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  35.06 
 
 
102 aa  47.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  33.33 
 
 
311 aa  47.8  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0669  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  39.19 
 
 
123 aa  47.4  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.163122  normal  0.0446226 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2967  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  35.82 
 
 
114 aa  47.4  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476557  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2964  hypothetical protein  31.51 
 
 
117 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2814  hypothetical protein  31.51 
 
 
117 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.25 
 
 
105 aa  47  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
294 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1004  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.65 
 
 
101 aa  47  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.749918 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.9 
 
 
289 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1079  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  29 
 
 
110 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0175517  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.91 
 
 
509 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194312 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.63 
 
 
523 aa  46.6  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.48 
 
 
362 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.9 
 
 
289 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03310  conserved hypothetical protein  31.18 
 
 
585 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7008  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.61 
 
 
527 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144463  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  29.29 
 
 
119 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  37.93 
 
 
338 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0162  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.29 
 
 
98 aa  45.8  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6409  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.73 
 
 
512 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971185  normal  0.172531 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6339  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.41 
 
 
125 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.515952 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.25 
 
 
518 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1780  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  36.76 
 
 
105 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.307476  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3081  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
114 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0978825  normal  0.175913 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>