159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6175 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3441  Rieske (2Fe-2S) domain protein  71.19 
 
 
599 aa  835    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6175  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
593 aa  1184    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659991  hitchhiker  0.00257919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  76.53 
 
 
594 aa  903    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1433  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  43.82 
 
 
604 aa  450  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4522  Rieske (2Fe-2S) region  33.64 
 
 
116 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2693  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.3 
 
 
506 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563055  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1307  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.56 
 
 
116 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.4 
 
 
289 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1335  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.56 
 
 
116 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000656447 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4335  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  36 
 
 
118 aa  61.6  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.69 
 
 
112 aa  61.2  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.11 
 
 
101 aa  60.1  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0662  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.56 
 
 
506 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.29 
 
 
649 aa  59.3  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1452  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  40 
 
 
112 aa  57.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00226382  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3443  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.31 
 
 
116 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36 
 
 
106 aa  57.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03310  conserved hypothetical protein  36.73 
 
 
585 aa  56.6  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0570  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.7 
 
 
506 aa  57  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0198905  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.29 
 
 
99 aa  56.6  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.29 
 
 
100 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.54 
 
 
504 aa  55.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  39.73 
 
 
111 aa  55.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468725  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  31.73 
 
 
315 aa  55.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.04 
 
 
521 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.29 
 
 
114 aa  54.7  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000457155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01479  dioxygenase, ferredoxin reductase component, putative  40.66 
 
 
559 aa  54.3  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.25 
 
 
100 aa  54.3  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2675  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.98 
 
 
506 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148641  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  32.88 
 
 
98 aa  53.5  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13360  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  38.27 
 
 
122 aa  53.5  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.823074  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  30.1 
 
 
110 aa  53.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.89 
 
 
158 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  36.36 
 
 
102 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2541  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.53 
 
 
506 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  34.88 
 
 
291 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  31.63 
 
 
103 aa  52  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3175  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.47 
 
 
506 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759164  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0780  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.65 
 
 
100 aa  51.6  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.12357  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.85 
 
 
309 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1327  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.75 
 
 
106 aa  50.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198751  normal  0.195781 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1668  assimilatory nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  36.84 
 
 
113 aa  50.8  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0880692  normal  0.298986 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  39.44 
 
 
521 aa  50.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1780  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  37.5 
 
 
105 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.307476  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  41.54 
 
 
388 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1662  Rieske (2Fe-2S) protein  34.15 
 
 
125 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3120  pyruvate oxidase  27.27 
 
 
656 aa  50.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.777401  normal  0.194873 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  33.33 
 
 
238 aa  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31 
 
 
123 aa  50.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2444  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.67 
 
 
117 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44307  normal  0.0794581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3238  Rieske 2Fe-2S family protein  34.72 
 
 
99 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0271  putative dioxygenase ferredoxin subunit  33.33 
 
 
102 aa  49.3  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1847  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.34 
 
 
118 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000145916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  41.43 
 
 
126 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.17 
 
 
100 aa  49.7  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  31.08 
 
 
289 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  36.11 
 
 
599 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23360  assimilatory nitrite reductase, small subunit  38.57 
 
 
108 aa  49.7  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0534419  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.82 
 
 
322 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1004  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  33.67 
 
 
101 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.749918 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.37 
 
 
509 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1001  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  32.32 
 
 
116 aa  48.5  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.58 
 
 
118 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  42.31 
 
 
285 aa  48.9  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  24.73 
 
 
270 aa  48.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26520  predicted protein  36.67 
 
 
150 aa  48.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.73 
 
 
344 aa  48.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.270675  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  41.57 
 
 
351 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2961  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  33.33 
 
 
111 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2105  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.26 
 
 
118 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2095  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  36.46 
 
 
108 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0602377  normal  0.0657417 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3123  Rieske (2Fe-2S) protein  28.75 
 
 
349 aa  47.8  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00337014  normal  0.164048 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0463  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  33.33 
 
 
131 aa  47.4  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.39 
 
 
102 aa  47.4  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5690  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.04 
 
 
104 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.14 
 
 
286 aa  47.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41540  assimilatory nitrite reductase small subunit  37.14 
 
 
108 aa  47  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4349  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.84 
 
 
516 aa  47  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504096  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0817  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  33.66 
 
 
103 aa  47  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.29 
 
 
171 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7008  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.62 
 
 
527 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144463  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3194  Rieske (2Fe-2S) region  30.95 
 
 
100 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.5117e-17  hitchhiker  4.2038099999999998e-22 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  27.75 
 
 
356 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1861  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.49 
 
 
105 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1397  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.99 
 
 
509 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1739  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.88 
 
 
101 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.91 
 
 
518 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  40.91 
 
 
296 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6432  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.99 
 
 
509 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1143  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  41.79 
 
 
103 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2888  PrnD  37.29 
 
 
370 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3526  assimilatory nitrite reductase small subunit  37.14 
 
 
108 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1113  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  30.7 
 
 
120 aa  46.2  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5421  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.36 
 
 
508 aa  47  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.91 
 
 
301 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2964  hypothetical protein  31.34 
 
 
117 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1489  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  34.15 
 
 
154 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0572  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  34.15 
 
 
152 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237046  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2918  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  34.15 
 
 
154 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3081  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.06 
 
 
114 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0978825  normal  0.175913 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>