196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0110 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0110  conserved hypothetical protein, NifU family protein  100 
 
 		 91 aa  186  1e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000197902  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1811  NifU family protein  77.53 
 
 		 90 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1630  NifU family protein  77.53 
 
 		 90 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1999  NifU family protein  77.53 
 
 		 90 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0061  NifU family protein  64.29 
 
 		 88 aa  122  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.269629  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1742  hypothetical protein  61.9 
 
 		 91 aa  121  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0211624  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1004  NifU family protein  61.9 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0012863  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  62.65 
 
 		 88 aa  116  9e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0330  nitrogen-fixing NifU-like protein  54.88 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1940  nitrogen-fixing NifU domain protein  60.92 
 
 		 93 aa  90.1  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  47.76 
 
 		 72 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  41.54 
 
 		 188 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.28 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  43.75 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  41.54 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  40.32 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  42.19 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  40 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  40.62 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  38.67 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  48.28 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  40.79 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  42.19 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  45.1 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  38.46 
 
 		 190 aa  57  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.75 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  38.46 
 
 		 190 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.75 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  53.06 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  40.62 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  41.03 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  42.19 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  50 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  39.19 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  43.75 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  41.33 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  38.46 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  42.25 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  40.62 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  39.74 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  40.62 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  41.33 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  48.89 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  35.9 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  39.06 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  51.11 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  37.5 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.06 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.21 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.1 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  40.62 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  42.19 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  39.06 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  39.06 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  40 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  39.68 
 
 		 326 aa  52.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  35.94 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  50 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  37.88 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  37.88 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.78 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  36.99 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  33.85 
 
 		 188 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.59 
 
 		 283 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  43.48 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  45.24 
 
 		 188 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  43.48 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  45.24 
 
 		 188 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  40 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  38.24 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  42.11 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  38.24 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  38.24 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  38.24 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  38.24 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  38.24 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  38.24 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  45.9 
 
 		 74 aa  50.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  38.24 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  38.24 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  38.24 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  38.24 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  37.88 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.5 
 
 		 200 aa  50.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  45.9 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  40.91 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.62 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.73 
 
 		 198 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  36.36 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.67 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  39.39 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.5 
 
 		 294 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  44.44 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  39.39 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  35.53 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.5 
 
 		 294 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  34.29 
 
 		 254 aa  50.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  39.39 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.62 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>