269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1940 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1940  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 93 aa  186  7e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1004  NifU family protein  64.04 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0012863  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1742  hypothetical protein  62.92 
 
 		 91 aa  115  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0211624  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0330  nitrogen-fixing NifU-like protein  51.65 
 
 		 91 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1811  NifU family protein  65.91 
 
 		 90 aa  114  5e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1999  NifU family protein  65.91 
 
 		 90 aa  114  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1630  NifU family protein  65.91 
 
 		 90 aa  114  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  66.25 
 
 		 88 aa  113  8.999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0061  NifU family protein  64.04 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.269629  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0110  conserved hypothetical protein, NifU family protein  60.92 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000197902  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  43.24 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  42.67 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  41.89 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  41.33 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  41.33 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  46.58 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  42.31 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  40.54 
 
 		 188 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  45.21 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  42.19 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  45.21 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  45.21 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  46.67 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.38 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  49.28 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  48.44 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  44.44 
 
 		 190 aa  62  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  47.76 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  51.43 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.38 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  49.18 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  52.38 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  43.75 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  44.44 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  47.56 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  45.31 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  47.56 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  47.83 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  48 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  43.08 
 
 		 189 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  45.68 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  40.74 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  43.24 
 
 		 183 aa  60.5  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  48 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  40.79 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  40.79 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  49.12 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.31 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.31 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.67 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  38.46 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  46 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  40.79 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  46 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.21 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  40 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  46 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  37.88 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.79 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  48 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  39.47 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46593  predicted protein  44.29 
 
 		 225 aa  57  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.78436  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.39 
 
 		 74 aa  57  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.38 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  36.92 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  40 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  36.92 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  43.66 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  40 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  36.92 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.38 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  36.92 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  42 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  45 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  50.88 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.12 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  46.03 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.36 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  49.18 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  45.21 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  40.54 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  45.45 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  46.15 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.06 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  47.46 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  47.46 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  47.46 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  47.46 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  47.46 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  47.46 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.26 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  47.46 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.73 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  47.46 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  47.46 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>