142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2596 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  100 
 
 
381 aa  771    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  86.4 
 
 
377 aa  664    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1616  HEAT repeat-containing PBS lyase  63.76 
 
 
375 aa  494  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000382095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2017  HEAT repeat-containing PBS lyase  62.96 
 
 
375 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1988  HEAT-like repeat-containing protein  62.96 
 
 
375 aa  485  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00393125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1970  HEAT-like repeat-containing protein  62.96 
 
 
375 aa  485  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000496262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2171  HEAT repeat-containing PBS lyase  62.96 
 
 
375 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0184822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3139  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  62.7 
 
 
375 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640173  normal  0.0140567 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2194  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  62.43 
 
 
375 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0153783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2314  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  62.96 
 
 
375 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000816736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2177  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  62.7 
 
 
375 aa  483  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2006  HEAT repeat-containing PBS lyase  62.17 
 
 
375 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000482717  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2231  HEAT repeat-containing PBS lyase  63.1 
 
 
335 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1489  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.58 
 
 
374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.451629  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1518  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.58 
 
 
374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  36.3 
 
 
1148 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.48 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.91 
 
 
831 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  37.5 
 
 
644 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.71 
 
 
1343 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.97 
 
 
1438 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  38.76 
 
 
838 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  34.36 
 
 
958 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  33.12 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.84 
 
 
192 aa  63.9  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.21 
 
 
510 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
321 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.57 
 
 
223 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  29.11 
 
 
1094 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.77 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1490  hypothetical protein  38.1 
 
 
83 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1519  hypothetical protein  38.1 
 
 
83 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.11 
 
 
208 aa  60.5  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.09 
 
 
666 aa  60.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  32.37 
 
 
321 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 
593 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1007  hypothetical protein  34.12 
 
 
86 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.83 
 
 
220 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  32.72 
 
 
546 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.51 
 
 
220 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.15 
 
 
325 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.94 
 
 
668 aa  56.2  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.88 
 
 
226 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  33.33 
 
 
493 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.68 
 
 
232 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.99 
 
 
223 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.05 
 
 
646 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  32.05 
 
 
1194 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.7 
 
 
121 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.78 
 
 
180 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  25.49 
 
 
646 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  30.5 
 
 
319 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  37.17 
 
 
299 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.89 
 
 
642 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.79 
 
 
370 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.83 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  30.89 
 
 
187 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.3 
 
 
1181 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  35.71 
 
 
1133 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.67 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  30.08 
 
 
959 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.94 
 
 
313 aa  50.4  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.72 
 
 
214 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.62 
 
 
157 aa  50.8  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  35.05 
 
 
286 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.04 
 
 
490 aa  50.1  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.75 
 
 
670 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2420  HEAT domain containing protein  27.2 
 
 
363 aa  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  28.28 
 
 
1224 aa  49.7  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.27 
 
 
302 aa  49.7  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03351  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.1 
 
 
285 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.158445  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  34.21 
 
 
186 aa  49.7  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.18 
 
 
220 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  25 
 
 
191 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.85 
 
 
198 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.86 
 
 
1139 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.99 
 
 
641 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.96 
 
 
221 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.46 
 
 
200 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.31 
 
 
492 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.63 
 
 
323 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0425  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.16 
 
 
197 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.74 
 
 
1412 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.45 
 
 
173 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.29 
 
 
408 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1251  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.03 
 
 
162 aa  48.5  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  34.29 
 
 
374 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  32.43 
 
 
428 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0517  hypothetical protein  33.66 
 
 
124 aa  47.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302016  normal  0.633318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.62 
 
 
320 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  38.46 
 
 
195 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
1041 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  32.1 
 
 
186 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  30.56 
 
 
1216 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  29.07 
 
 
299 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.4 
 
 
200 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.03 
 
 
220 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.03 
 
 
220 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.88 
 
 
299 aa  47  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
408 aa  46.6  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>