87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0517 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0517  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  248  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302016  normal  0.633318 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  44.76 
 
 
157 aa  90.5  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  45.22 
 
 
208 aa  90.1  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  40 
 
 
173 aa  84.7  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.54 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.38 
 
 
1343 aa  67.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.22 
 
 
399 aa  60.1  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.55 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  37.3 
 
 
1094 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
302 aa  55.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2742  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.73 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  37.96 
 
 
1148 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.93 
 
 
510 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.21 
 
 
524 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.19 
 
 
370 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.62 
 
 
1139 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0647  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.77 
 
 
391 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0674  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.77 
 
 
391 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  30.39 
 
 
1133 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  36.63 
 
 
643 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0959  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.57 
 
 
220 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0932  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.57 
 
 
220 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.4 
 
 
251 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.73 
 
 
320 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.02 
 
 
1181 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  36.11 
 
 
838 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  31.82 
 
 
501 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  35.45 
 
 
546 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.9 
 
 
180 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  32.46 
 
 
1328 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  34.86 
 
 
958 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  33.66 
 
 
381 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.37 
 
 
313 aa  47.4  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.02 
 
 
831 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.84 
 
 
192 aa  47.4  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.41 
 
 
220 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.43 
 
 
395 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.63 
 
 
323 aa  47  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
377 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2052  HEAT domain containing protein  27.97 
 
 
220 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00216724  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  29.57 
 
 
319 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.02 
 
 
331 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.63 
 
 
642 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  35 
 
 
1141 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  33.68 
 
 
493 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.39 
 
 
325 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  32.32 
 
 
959 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  32.95 
 
 
299 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07498  Deoxyhypusine hydroxylase (DOHH)(EC 1.14.99.29)(Deoxyhypusine monooxygenase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW32]  35.63 
 
 
336 aa  44.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.63 
 
 
641 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1616  HEAT repeat-containing PBS lyase  35 
 
 
375 aa  44.3  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000382095  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  27.73 
 
 
199 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  34.86 
 
 
402 aa  44.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.96 
 
 
1041 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  29.57 
 
 
319 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.74 
 
 
408 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  40.68 
 
 
431 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  32.43 
 
 
1224 aa  42.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  28.41 
 
 
218 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.37 
 
 
646 aa  42.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4453  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.28 
 
 
326 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  36.94 
 
 
773 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1292  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00634869  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.02 
 
 
331 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.61 
 
 
642 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  30.68 
 
 
644 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1170  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.63 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0423  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.19 
 
 
534 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0642387  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.18 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.808601  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.63 
 
 
670 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79203  phycocyanin alpha-subunit phycocyanobilin lyase  28.7 
 
 
318 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.94 
 
 
176 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  26.04 
 
 
325 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1674  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.22 
 
 
287 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.159661  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.16 
 
 
1438 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03881  HEAT repeat-containing protein  32.22 
 
 
287 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87651  normal  0.0403253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4786  heat domain-containing protein  31.25 
 
 
366 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  28.68 
 
 
428 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1453  hypothetical protein  37.18 
 
 
370 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0241  diguanylate cyclase  30.51 
 
 
450 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.69 
 
 
321 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.56 
 
 
220 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2239  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.79 
 
 
220 aa  40.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3287  serine/threonine protein kinase  36.78 
 
 
940 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.092483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  38.1 
 
 
326 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4227  HEAT domain containing protein  29.57 
 
 
756 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  33.33 
 
 
646 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>