112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1251 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1251  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 
162 aa  331  2e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07498  Deoxyhypusine hydroxylase (DOHH)(EC 1.14.99.29)(Deoxyhypusine monooxygenase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW32]  43.22 
 
 
336 aa  71.6  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05340  riken protein, putative  35.48 
 
 
361 aa  64.3  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79203  phycocyanin alpha-subunit phycocyanobilin lyase  37.93 
 
 
318 aa  60.8  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  34.68 
 
 
644 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.93 
 
 
226 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0462  hypothetical protein  34.88 
 
 
174 aa  57.8  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000287301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  33.9 
 
 
1148 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.87 
 
 
1343 aa  57  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  30.82 
 
 
1224 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  31.15 
 
 
546 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.43 
 
 
234 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  36.97 
 
 
493 aa  55.1  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18290  predicted protein  39.33 
 
 
305 aa  55.1  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0512622 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5730  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
201 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.76 
 
 
223 aa  54.7  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.45 
 
 
1139 aa  54.7  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.08 
 
 
220 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.08 
 
 
220 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  33.33 
 
 
320 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.02 
 
 
323 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.62 
 
 
192 aa  52.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.9 
 
 
1181 aa  53.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.59 
 
 
399 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3712  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.4 
 
 
283 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13018  normal  0.417711 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.91 
 
 
377 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  34.81 
 
 
958 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.17 
 
 
395 aa  52  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.28 
 
 
321 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.87 
 
 
313 aa  50.8  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 
593 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.16 
 
 
214 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 
223 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.62 
 
 
208 aa  50.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  32.14 
 
 
1094 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  31.82 
 
 
431 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.65 
 
 
642 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  39.78 
 
 
374 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.71 
 
 
667 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.11 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  33.6 
 
 
321 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  29.37 
 
 
1133 aa  48.9  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  31.03 
 
 
381 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  35.79 
 
 
517 aa  48.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.44 
 
 
221 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  30.47 
 
 
1110 aa  47.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  31.36 
 
 
319 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.78 
 
 
641 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.57 
 
 
510 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.91 
 
 
857 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.91 
 
 
857 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_002936  DET0524  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.09 
 
 
316 aa  47  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.25489  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.97 
 
 
285 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.48 
 
 
232 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.32 
 
 
1438 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.25 
 
 
325 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.48 
 
 
642 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.61 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_465  PBS lyase heat-like repeat domain protein  28.7 
 
 
316 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.089505  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  31.36 
 
 
321 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.33 
 
 
390 aa  45.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.18 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0500  heat domain-containing protein  27.83 
 
 
316 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.332473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2754  HEAT domain containing protein  30 
 
 
273 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202465  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.48 
 
 
831 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
331 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.1 
 
 
846 aa  44.7  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  30.08 
 
 
959 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.41 
 
 
251 aa  45.1  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.92 
 
 
173 aa  44.7  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  40 
 
 
524 aa  44.3  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1616  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.52 
 
 
375 aa  44.3  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000382095  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0342  HEAT repeat-containing PBS lyase  45 
 
 
101 aa  44.3  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.649618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  39.2 
 
 
773 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.53 
 
 
212 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4094  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.64 
 
 
522 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4227  HEAT domain containing protein  34.92 
 
 
756 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01700  26S proteasome regulatory subunit Rpn2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08480)  28.97 
 
 
1144 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0581702 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3836  HEAT repeat-containing protein  38.04 
 
 
533 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2426  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.36 
 
 
464 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  31.09 
 
 
321 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.68 
 
 
302 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1735  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
487 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00210534  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  40 
 
 
320 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2314  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  33.04 
 
 
375 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000816736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2177  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  33.04 
 
 
375 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3139  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  33.04 
 
 
375 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640173  normal  0.0140567 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2420  HEAT domain containing protein  34.38 
 
 
363 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2190  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.58 
 
 
411 aa  42.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.16 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07440  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.89 
 
 
381 aa  42.4  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4824  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
712 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.329742  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  39.76 
 
 
501 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4513  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.39 
 
 
208 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.283819  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0542  HEAT domain containing protein  33.94 
 
 
250 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2231  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.17 
 
 
335 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2382  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.17 
 
 
234 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.509121  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0647  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.46 
 
 
391 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0674  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.46 
 
 
391 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  30.08 
 
 
838 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>