35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL05340 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL05340  riken protein, putative  100 
 
 
361 aa  735    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79203  phycocyanin alpha-subunit phycocyanobilin lyase  45.32 
 
 
318 aa  247  3e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07498  Deoxyhypusine hydroxylase (DOHH)(EC 1.14.99.29)(Deoxyhypusine monooxygenase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW32]  45.57 
 
 
336 aa  224  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18290  predicted protein  38.1 
 
 
305 aa  145  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0512622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  29 
 
 
1094 aa  73.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.54 
 
 
1343 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1251  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.48 
 
 
162 aa  64.3  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  27.85 
 
 
1148 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  28.24 
 
 
1224 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.02 
 
 
323 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  26.54 
 
 
644 aa  53.5  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.04 
 
 
1139 aa  52.8  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.22 
 
 
313 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.23 
 
 
510 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.73 
 
 
1438 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  26.92 
 
 
493 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_465  PBS lyase heat-like repeat domain protein  30.08 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.089505  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1489  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.44 
 
 
374 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.451629  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1518  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.44 
 
 
374 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.16 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  25.87 
 
 
959 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0500  heat domain-containing protein  29.6 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.332473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  34.26 
 
 
320 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.68 
 
 
192 aa  47  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  27.72 
 
 
1328 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  25.11 
 
 
958 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.31 
 
 
251 aa  46.6  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.21 
 
 
121 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0462  hypothetical protein  25.9 
 
 
174 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000287301 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5730  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.48 
 
 
201 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.1 
 
 
490 aa  43.5  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.46 
 
 
234 aa  43.5  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  30.91 
 
 
838 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.11 
 
 
408 aa  43.1  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.51 
 
 
821 aa  43.1  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>