52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0500 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0500  heat domain-containing protein  100 
 
 		 316 aa  644    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.332473  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_465  PBS lyase heat-like repeat domain protein  89.24 
 
 		 316 aa  589  1e-167  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.089505  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0524  HEAT repeat-containing PBS lyase  84.49 
 
 		 316 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.25489  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3973  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.31 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629775  normal  0.213011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1417  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.12 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.970236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3051  HEAT domain containing protein  33.79 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.593239  hitchhiker  0.000276879 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0952  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.04 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0081  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.69 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  27.92 
 
 		 546 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.17 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  27.37 
 
 		 958 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.09 
 
 		 1343 aa  60.1  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  24.86 
 
 		 428 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  24.9 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  25.1 
 
 		 493 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.32 
 
 		 524 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.72 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.19 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.23 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.1 
 
 		 173 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  23.67 
 
 		 501 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.67 
 
 		 642 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1224 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  21.94 
 
 		 959 aa  50.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0959  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.85 
 
 		 220 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0932  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.85 
 
 		 220 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  23.98 
 
 		 299 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.19 
 
 		 395 aa  49.7  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.71 
 
 		 641 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1094 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.57 
 
 		 192 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  25.69 
 
 		 838 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.83 
 
 		 510 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.27 
 
 		 490 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05340  riken protein, putative  29.6 
 
 		 361 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  22.53 
 
 		 1181 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  22.53 
 
 		 395 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  22.53 
 
 		 395 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1251  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.83 
 
 		 162 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  26.42 
 
 		 1133 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.57 
 
 		 670 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.71 
 
 		 642 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2123  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.04 
 
 		 635 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209503  normal  0.0989309 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  27.27 
 
 		 218 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  31.75 
 
 		 646 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.89 
 
 		 220 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  27.36 
 
 		 951 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.95 
 
 		 646 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.62 
 
 		 157 aa  42.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.46 
 
 		 1139 aa  42.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0437  HEAT repeat-containing PBS lyase  25 
 
 		 489 aa  42.7  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000498384  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1896  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.76 
 
 		 298 aa  42.4  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>