More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4824 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4824  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 712 aa  1364    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.329742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2267  sucrose-phosphate phosphatase  28.1 
 
 		 721 aa  98.6  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2912  sucrose-phosphate synthase  26.67 
 
 		 718 aa  91.3  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0143  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.64 
 
 		 684 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279801  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18210  Sucrose-phosphate synthase  24.37 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.338675  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0177  Sucrose synthase  25.37 
 
 		 792 aa  83.2  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2689  sucrose-phosphate synthase  27.42 
 
 		 707 aa  81.3  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.288748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2315  sucrose-phosphate synthase  26.4 
 
 		 709 aa  80.9  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 438 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.79 
 
 		 688 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.533678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0200  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 684 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.72 
 
 		 495 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.72 
 
 		 443 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2312  sucrose-phosphate synthase  27.38 
 
 		 723 aa  77  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.407263 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.72 
 
 		 499 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.72 
 
 		 443 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.72 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3068  sucrose synthase  27.63 
 
 		 795 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.72 
 
 		 498 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.72 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1752  Sucrose synthase  29.19 
 
 		 806 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21951  sucrose phosphate synthase  24.38 
 
 		 702 aa  76.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.269726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1552  sucrose synthase, putative  32.58 
 
 		 814 aa  75.5  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1268  Sucrose synthase  32.58 
 
 		 793 aa  75.1  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209481  normal  0.340227 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1322  sucrose-phosphate synthase  23.92 
 
 		 708 aa  74.7  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.435001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 		 439 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2610  sucrose-phosphate synthase, glycosyltransferase region  23.96 
 
 		 725 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 		 439 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 		 439 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3069  HAD family hydrolase  27.38 
 
 		 720 aa  72.4  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1794  sucrose-phosphate synthase  23.73 
 
 		 724 aa  72.4  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399032  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 438 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0708  sucrose-phosphate synthase  26.82 
 
 		 722 aa  70.5  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  37.65 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 		 401 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3516  sucrose-phosphate synthase  27.1 
 
 		 716 aa  68.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18491  sucrose phosphate synthase  26.41 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.179299 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0650  sucrose-phosphate synthase  24.34 
 
 		 735 aa  67.8  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238518  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0227  sucrose-phosphate synthase  25.4 
 
 		 784 aa  67.8  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0808  HAD family hydrolase  30 
 
 		 709 aa  67.8  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30171  sucrose phosphate synthase  26.94 
 
 		 707 aa  67.4  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 437 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 437 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19201  sucrose phosphate synthase  28.19 
 
 		 469 aa  67  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.8791  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  34 
 
 		 382 aa  66.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2283  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  22.62 
 
 		 806 aa  65.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.356959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19021  sucrose phosphate synthase  28.86 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.756574  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  35.53 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  30.46 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  26.49 
 
 		 650 aa  64.3  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  34.67 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2266  sucrose synthase  28.64 
 
 		 794 aa  63.9  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.856509  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 		 672 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 440 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3776  Sucrose synthase  23.99 
 
 		 805 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19011  sucrose phosphate synthase  27.52 
 
 		 469 aa  63.9  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.799465  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 		 402 aa  63.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 		 426 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  29.47 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1267  sucrose-phosphate synthase  28.77 
 
 		 714 aa  62.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.327347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1551  sucrose phosphate synthase  28.77 
 
 		 714 aa  62.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 410 aa  63.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  31 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 360 aa  62.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 		 448 aa  62  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 435 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 394 aa  62  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 		 390 aa  62  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  33.74 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  28.94 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  29.9 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 		 376 aa  60.1  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3967  sucrose-phosphate phosphatase subfamily protein  27.71 
 
 		 729 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 		 386 aa  60.1  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.62 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1867  sucrose-phosphate synthase  28.64 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1803  sucrose-phosphate synthase  26.17 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  24.65 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>