More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0177 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1268  Sucrose synthase  56.22 
 
 
793 aa  866    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209481  normal  0.340227 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1752  Sucrose synthase  49.67 
 
 
806 aa  771    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353077  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0215  sucrose synthase  41.72 
 
 
809 aa  652    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413159  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2283  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  47.85 
 
 
806 aa  760    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.356959  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3753  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  42.15 
 
 
805 aa  647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.115007 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3068  sucrose synthase  65 
 
 
795 aa  1025    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1552  sucrose synthase, putative  56.22 
 
 
814 aa  868    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2266  sucrose synthase  59.46 
 
 
794 aa  914    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.856509  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3776  Sucrose synthase  48.96 
 
 
805 aa  756    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3916  Sucrose synthase  43.3 
 
 
803 aa  656    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.067328 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0177  Sucrose synthase  100 
 
 
792 aa  1606    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2312  sucrose-phosphate synthase  32.19 
 
 
723 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.407263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0650  sucrose-phosphate synthase  29.51 
 
 
735 aa  189  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238518  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3516  sucrose-phosphate synthase  30.43 
 
 
716 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18210  Sucrose-phosphate synthase  29.74 
 
 
496 aa  175  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.338675  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0227  sucrose-phosphate synthase  30.6 
 
 
784 aa  174  7.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2912  sucrose-phosphate synthase  30 
 
 
718 aa  172  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3683  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.59 
 
 
762 aa  171  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2267  sucrose-phosphate phosphatase  30.74 
 
 
721 aa  169  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2610  sucrose-phosphate synthase, glycosyltransferase region  28.51 
 
 
725 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2689  sucrose-phosphate synthase  29.96 
 
 
707 aa  162  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.288748  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0708  sucrose-phosphate synthase  28.6 
 
 
722 aa  162  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1267  sucrose-phosphate synthase  30.75 
 
 
714 aa  160  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.327347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1551  sucrose phosphate synthase  30.75 
 
 
714 aa  160  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2315  sucrose-phosphate synthase  29.6 
 
 
709 aa  158  4e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3967  sucrose-phosphate phosphatase subfamily protein  28.19 
 
 
729 aa  158  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1803  sucrose-phosphate synthase  27.02 
 
 
469 aa  157  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3069  HAD family hydrolase  28.36 
 
 
720 aa  154  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0808  HAD family hydrolase  28.83 
 
 
709 aa  153  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19011  sucrose phosphate synthase  27.31 
 
 
469 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.799465  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1794  sucrose-phosphate synthase  30.38 
 
 
724 aa  152  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399032  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19201  sucrose phosphate synthase  27.22 
 
 
469 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.8791  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0446  sucrose-phosphate synthase  25.2 
 
 
479 aa  150  8e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1867  sucrose-phosphate synthase  26.69 
 
 
472 aa  149  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30171  sucrose phosphate synthase  29.54 
 
 
707 aa  149  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19021  sucrose phosphate synthase  27.25 
 
 
470 aa  147  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.756574  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18491  sucrose phosphate synthase  26.16 
 
 
466 aa  145  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.179299 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21951  sucrose phosphate synthase  27.94 
 
 
702 aa  144  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.269726  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0533  sucrose synthase  25 
 
 
423 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1322  sucrose-phosphate synthase  27.96 
 
 
708 aa  141  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.435001  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0143  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.01 
 
 
684 aa  105  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279801  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0200  HAD family hydrolase  28.22 
 
 
684 aa  103  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.96 
 
 
688 aa  100  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.533678  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 
439 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.05 
 
 
443 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.05 
 
 
443 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.05 
 
 
498 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
438 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  27.45 
 
 
443 aa  81.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.84 
 
 
443 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.84 
 
 
495 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4824  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
712 aa  79.7  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.329742  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.84 
 
 
499 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.84 
 
 
443 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
434 aa  79  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
440 aa  77.8  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
438 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  24.27 
 
 
438 aa  77  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  28.19 
 
 
650 aa  74.3  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
373 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.14 
 
 
405 aa  70.5  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
421 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
419 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
415 aa  69.7  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 
448 aa  69.7  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  25.15 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 
458 aa  69.3  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  25 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0427  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
460 aa  68.6  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.049978  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  22.63 
 
 
672 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
435 aa  67.4  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 
353 aa  67.4  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
405 aa  66.2  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  37.89 
 
 
346 aa  66.2  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
381 aa  65.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
421 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  29.5 
 
 
363 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  35 
 
 
384 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  41.51 
 
 
419 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
414 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 
401 aa  64.7  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
360 aa  64.7  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  28.97 
 
 
379 aa  64.3  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  28.71 
 
 
411 aa  64.3  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0797  glycosyltransferase  31.45 
 
 
369 aa  63.9  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  26.7 
 
 
404 aa  63.9  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.32 
 
 
382 aa  63.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  27.05 
 
 
398 aa  63.5  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
381 aa  63.9  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
419 aa  63.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  25.77 
 
 
397 aa  63.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>