More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_3068 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2283  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  45.6 
 
 
806 aa  733    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.356959  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3753  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  40.31 
 
 
805 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.115007 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3068  sucrose synthase  100 
 
 
795 aa  1643    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2266  sucrose synthase  57.68 
 
 
794 aa  927    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.856509  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0177  Sucrose synthase  65 
 
 
792 aa  1024    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1268  Sucrose synthase  54.64 
 
 
793 aa  867    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209481  normal  0.340227 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0215  sucrose synthase  39.59 
 
 
809 aa  639    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413159  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1552  sucrose synthase, putative  54.64 
 
 
814 aa  868    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3776  Sucrose synthase  47.07 
 
 
805 aa  734    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1752  Sucrose synthase  46.21 
 
 
806 aa  726    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353077  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3916  Sucrose synthase  39.55 
 
 
803 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.067328 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3516  sucrose-phosphate synthase  28.95 
 
 
716 aa  174  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2312  sucrose-phosphate synthase  29.55 
 
 
723 aa  174  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.407263 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2912  sucrose-phosphate synthase  28.98 
 
 
718 aa  169  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1803  sucrose-phosphate synthase  28.48 
 
 
469 aa  164  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0650  sucrose-phosphate synthase  27.57 
 
 
735 aa  163  9e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238518  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2267  sucrose-phosphate phosphatase  29.68 
 
 
721 aa  162  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19021  sucrose phosphate synthase  27.45 
 
 
470 aa  161  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.756574  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0227  sucrose-phosphate synthase  28.26 
 
 
784 aa  159  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19201  sucrose phosphate synthase  27.66 
 
 
469 aa  156  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.8791  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19011  sucrose phosphate synthase  27.42 
 
 
469 aa  156  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.799465  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2689  sucrose-phosphate synthase  28.51 
 
 
707 aa  153  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.288748  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1794  sucrose-phosphate synthase  27.97 
 
 
724 aa  152  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399032  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2610  sucrose-phosphate synthase, glycosyltransferase region  27.96 
 
 
725 aa  151  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3683  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.2 
 
 
762 aa  150  9e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0708  sucrose-phosphate synthase  26.74 
 
 
722 aa  148  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18491  sucrose phosphate synthase  26.15 
 
 
466 aa  147  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.179299 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0446  sucrose-phosphate synthase  27.07 
 
 
479 aa  146  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0808  HAD family hydrolase  27.97 
 
 
709 aa  146  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2315  sucrose-phosphate synthase  27.27 
 
 
709 aa  146  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18210  Sucrose-phosphate synthase  27.71 
 
 
496 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.338675  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1551  sucrose phosphate synthase  27.59 
 
 
714 aa  144  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1267  sucrose-phosphate synthase  27.59 
 
 
714 aa  144  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.327347 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3069  HAD family hydrolase  27.76 
 
 
720 aa  142  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30171  sucrose phosphate synthase  28 
 
 
707 aa  142  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0533  sucrose synthase  26.42 
 
 
423 aa  139  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1867  sucrose-phosphate synthase  26.12 
 
 
472 aa  139  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21951  sucrose phosphate synthase  25.85 
 
 
702 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.269726  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1322  sucrose-phosphate synthase  25.74 
 
 
708 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.435001  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3967  sucrose-phosphate phosphatase subfamily protein  26.97 
 
 
729 aa  135  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.16 
 
 
688 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.533678  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0143  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.51 
 
 
684 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279801  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0200  HAD family hydrolase  34.9 
 
 
684 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  30.3 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4824  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
712 aa  73.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.329742  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 
435 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  21.8 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  24 
 
 
672 aa  70.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.24 
 
 
388 aa  68.2  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  23.16 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
453 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  22.47 
 
 
438 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  22.47 
 
 
438 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
415 aa  65.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  21.74 
 
 
439 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.94 
 
 
405 aa  65.1  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  23.28 
 
 
650 aa  65.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  23.59 
 
 
422 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.53 
 
 
443 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3338  glycosyl transferase, group 1  36.99 
 
 
415 aa  65.1  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.620464  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  21.19 
 
 
440 aa  65.1  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.53 
 
 
443 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1022  hypothetical protein  25 
 
 
417 aa  64.7  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 
434 aa  64.7  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  21.74 
 
 
439 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  21.74 
 
 
439 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.53 
 
 
498 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
424 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  23.79 
 
 
404 aa  63.9  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  25.57 
 
 
409 aa  63.5  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  24.52 
 
 
416 aa  63.2  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
421 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
434 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  22.24 
 
 
438 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  23.12 
 
 
458 aa  62.4  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  22.71 
 
 
387 aa  62  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 
446 aa  62  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  24.69 
 
 
387 aa  62.4  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.53 
 
 
443 aa  62  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.53 
 
 
443 aa  62  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.53 
 
 
495 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.53 
 
 
499 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  37.89 
 
 
384 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  27.34 
 
 
431 aa  60.1  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  24.76 
 
 
406 aa  60.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  25.79 
 
 
443 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
419 aa  60.1  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 
353 aa  59.7  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
402 aa  59.7  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  23.21 
 
 
405 aa  59.3  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 
401 aa  59.3  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
387 aa  58.9  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  21.92 
 
 
404 aa  58.9  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 
379 aa  58.5  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
386 aa  58.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
369 aa  58.5  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
421 aa  58.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>