More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1552 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3776  Sucrose synthase  45.31 
 
 
805 aa  687    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2283  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  46.94 
 
 
806 aa  691    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.356959  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3068  sucrose synthase  54.64 
 
 
795 aa  859    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1552  sucrose synthase, putative  100 
 
 
814 aa  1682    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2266  sucrose synthase  55.23 
 
 
794 aa  851    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.856509  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0177  Sucrose synthase  56.36 
 
 
792 aa  863    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1752  Sucrose synthase  43.37 
 
 
806 aa  680    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353077  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1268  Sucrose synthase  100 
 
 
793 aa  1637    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209481  normal  0.340227 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0215  sucrose synthase  40.11 
 
 
809 aa  595  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413159  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3753  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  40.11 
 
 
805 aa  589  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.115007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3916  Sucrose synthase  42.22 
 
 
803 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.067328 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2912  sucrose-phosphate synthase  28.6 
 
 
718 aa  177  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2312  sucrose-phosphate synthase  29.37 
 
 
723 aa  177  8e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.407263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0650  sucrose-phosphate synthase  28.2 
 
 
735 aa  172  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238518  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3516  sucrose-phosphate synthase  29.55 
 
 
716 aa  169  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1794  sucrose-phosphate synthase  31.31 
 
 
724 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399032  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2689  sucrose-phosphate synthase  29.88 
 
 
707 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.288748  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2315  sucrose-phosphate synthase  28.95 
 
 
709 aa  163  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2610  sucrose-phosphate synthase, glycosyltransferase region  28.31 
 
 
725 aa  163  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1803  sucrose-phosphate synthase  27.51 
 
 
469 aa  160  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0708  sucrose-phosphate synthase  28.69 
 
 
722 aa  159  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3683  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.6 
 
 
762 aa  158  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19201  sucrose phosphate synthase  27.69 
 
 
469 aa  157  6e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.8791  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2267  sucrose-phosphate phosphatase  28.81 
 
 
721 aa  157  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0227  sucrose-phosphate synthase  28.14 
 
 
784 aa  155  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18491  sucrose phosphate synthase  28.31 
 
 
466 aa  153  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.179299 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0808  HAD family hydrolase  29.22 
 
 
709 aa  153  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19011  sucrose phosphate synthase  27.05 
 
 
469 aa  153  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.799465  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3967  sucrose-phosphate phosphatase subfamily protein  27.88 
 
 
729 aa  153  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21951  sucrose phosphate synthase  26.51 
 
 
702 aa  151  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.269726  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3069  HAD family hydrolase  27.59 
 
 
720 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1322  sucrose-phosphate synthase  27.11 
 
 
708 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.435001  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19021  sucrose phosphate synthase  27.11 
 
 
470 aa  148  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.756574  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30171  sucrose phosphate synthase  27.64 
 
 
707 aa  146  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1267  sucrose-phosphate synthase  28.17 
 
 
714 aa  145  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.327347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1551  sucrose phosphate synthase  28.17 
 
 
714 aa  145  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0446  sucrose-phosphate synthase  25.11 
 
 
479 aa  133  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1867  sucrose-phosphate synthase  25.15 
 
 
472 aa  131  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18210  Sucrose-phosphate synthase  24.52 
 
 
496 aa  130  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.338675  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0533  sucrose synthase  25.89 
 
 
423 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0200  HAD family hydrolase  29.44 
 
 
684 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0143  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.21 
 
 
684 aa  115  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279801  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.1 
 
 
688 aa  111  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.533678  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
363 aa  72  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  29.12 
 
 
442 aa  70.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  22.51 
 
 
405 aa  70.5  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  34.64 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4824  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
712 aa  69.7  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.329742  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  23.36 
 
 
404 aa  69.7  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  32.17 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  25.1 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  51.61 
 
 
360 aa  67  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
421 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  36.94 
 
 
536 aa  66.6  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
376 aa  65.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 
672 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
419 aa  65.1  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.5 
 
 
405 aa  64.7  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
361 aa  64.7  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.16 
 
 
498 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.2 
 
 
443 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  25.56 
 
 
443 aa  63.9  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.2 
 
 
443 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  26.25 
 
 
388 aa  63.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1918  UDP-glucose:tetrahydrobiopterin glucosyltransferase  48.39 
 
 
359 aa  62.8  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3338  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
415 aa  63.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.620464  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  23.41 
 
 
395 aa  62.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
414 aa  63.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  24.72 
 
 
419 aa  62.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1763  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
419 aa  62.4  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.410209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  23.31 
 
 
440 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
381 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 
415 aa  62.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  22.88 
 
 
399 aa  62.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  25.85 
 
 
387 aa  62  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  24.6 
 
 
431 aa  62  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 
414 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.27 
 
 
388 aa  62  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  23.01 
 
 
437 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
375 aa  61.6  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  23.01 
 
 
437 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
360 aa  61.6  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  21.16 
 
 
448 aa  61.6  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  24 
 
 
394 aa  61.6  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16521  glycosyl transferases group 1  34.02 
 
 
369 aa  61.6  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.524889 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.16 
 
 
495 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.16 
 
 
499 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.2 
 
 
443 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.2 
 
 
443 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
403 aa  60.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  28.92 
 
 
411 aa  60.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  34.83 
 
 
384 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  21.31 
 
 
453 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  21.21 
 
 
405 aa  60.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13711  glycosyl transferases group 1  36.71 
 
 
358 aa  60.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.193432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>