More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1794 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_3069  HAD family hydrolase  48.03 
 
 		 720 aa  692    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1794  sucrose-phosphate synthase  100 
 
 		 724 aa  1492    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399032  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2312  sucrose-phosphate synthase  52.96 
 
 		 723 aa  762    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.407263 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0808  HAD family hydrolase  46.25 
 
 		 709 aa  636    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2267  sucrose-phosphate phosphatase  47.33 
 
 		 721 aa  649    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2610  sucrose-phosphate synthase, glycosyltransferase region  45.59 
 
 		 725 aa  651    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2912  sucrose-phosphate synthase  57.08 
 
 		 718 aa  834    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3516  sucrose-phosphate synthase  57.97 
 
 		 716 aa  861    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0708  sucrose-phosphate synthase  52.82 
 
 		 722 aa  756    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0227  sucrose-phosphate synthase  47.23 
 
 		 784 aa  634  1e-180  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0650  sucrose-phosphate synthase  44.24 
 
 		 735 aa  595  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238518  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1551  sucrose phosphate synthase  45.47 
 
 		 714 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1267  sucrose-phosphate synthase  45.47 
 
 		 714 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.327347 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1322  sucrose-phosphate synthase  39.53 
 
 		 708 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.435001  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30171  sucrose phosphate synthase  40.81 
 
 		 707 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2315  sucrose-phosphate synthase  39.17 
 
 		 709 aa  498  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21951  sucrose phosphate synthase  39.48 
 
 		 702 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.269726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2689  sucrose-phosphate synthase  39.51 
 
 		 707 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.288748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3967  sucrose-phosphate phosphatase subfamily protein  40.96 
 
 		 729 aa  494  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3683  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.2 
 
 		 762 aa  464  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0143  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.84 
 
 		 684 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279801  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0200  HAD family hydrolase  38.12 
 
 		 684 aa  421  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.34 
 
 		 688 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.533678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19011  sucrose phosphate synthase  47.34 
 
 		 469 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.799465  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1803  sucrose-phosphate synthase  46.88 
 
 		 469 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19201  sucrose phosphate synthase  47.11 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.8791  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18491  sucrose phosphate synthase  46.98 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.179299 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19021  sucrose phosphate synthase  44.34 
 
 		 470 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.756574  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18210  Sucrose-phosphate synthase  34.4 
 
 		 496 aa  232  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.338675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1867  sucrose-phosphate synthase  31.4 
 
 		 472 aa  211  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0446  sucrose-phosphate synthase  32.75 
 
 		 479 aa  210  8e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0533  sucrose synthase  33.11 
 
 		 423 aa  190  8e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3776  Sucrose synthase  31.4 
 
 		 805 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1752  Sucrose synthase  30.46 
 
 		 806 aa  180  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2283  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 		 806 aa  178  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.356959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1552  sucrose synthase, putative  31.31 
 
 		 814 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1268  Sucrose synthase  30.51 
 
 		 793 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209481  normal  0.340227 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 424 aa  163  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 		 453 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0177  Sucrose synthase  29.94 
 
 		 792 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.89 
 
 		 423 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3068  sucrose synthase  27.97 
 
 		 795 aa  152  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 		 419 aa  150  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 		 426 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2266  sucrose synthase  27.17 
 
 		 794 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.856509  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3916  Sucrose synthase  28.71 
 
 		 803 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.067328 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 448 aa  146  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3753  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 805 aa  144  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.115007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  27.63 
 
 		 650 aa  140  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 		 425 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 		 422 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 672 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4476  sucrose phosphatase  33.06 
 
 		 249 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 435 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0215  sucrose synthase  26.16 
 
 		 809 aa  129  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413159  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 		 434 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 		 419 aa  127  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 		 438 aa  127  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 438 aa  127  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  27.69 
 
 		 417 aa  126  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 		 434 aa  126  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 		 422 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 		 402 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 430 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 438 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 		 482 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 448 aa  122  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  26.38 
 
 		 442 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 439 aa  120  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 		 439 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 		 439 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 421 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  27.4 
 
 		 424 aa  119  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 		 448 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 		 450 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2821  sucrose-phosphate phosphatase  31.97 
 
 		 249 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.498458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  27.16 
 
 		 443 aa  115  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  27.72 
 
 		 443 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  28.22 
 
 		 431 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  27.43 
 
 		 403 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.64 
 
 		 443 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  27.27 
 
 		 417 aa  112  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.64 
 
 		 443 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.64 
 
 		 498 aa  111  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4592  sucrose phosphatase  30.45 
 
 		 252 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  28.25 
 
 		 450 aa  110  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 		 440 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  25.98 
 
 		 426 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  26.4 
 
 		 420 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.58 
 
 		 443 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 435 aa  109  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 420 aa  109  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  27.6 
 
 		 458 aa  109  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.58 
 
 		 499 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.58 
 
 		 443 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  26.45 
 
 		 427 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.58 
 
 		 495 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  27.29 
 
 		 397 aa  108  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>