More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3683 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3683  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 
762 aa  1563    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0650  sucrose-phosphate synthase  41.07 
 
 
735 aa  533  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238518  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2610  sucrose-phosphate synthase, glycosyltransferase region  38.9 
 
 
725 aa  511  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3516  sucrose-phosphate synthase  38.99 
 
 
716 aa  500  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0808  HAD family hydrolase  38.99 
 
 
709 aa  488  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2267  sucrose-phosphate phosphatase  38.74 
 
 
721 aa  479  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2312  sucrose-phosphate synthase  38.7 
 
 
723 aa  480  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.407263 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3967  sucrose-phosphate phosphatase subfamily protein  36.4 
 
 
729 aa  467  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3069  HAD family hydrolase  37.8 
 
 
720 aa  465  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1794  sucrose-phosphate synthase  37.3 
 
 
724 aa  465  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399032  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2912  sucrose-phosphate synthase  37.55 
 
 
718 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0708  sucrose-phosphate synthase  37.05 
 
 
722 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1267  sucrose-phosphate synthase  36.18 
 
 
714 aa  421  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.327347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1551  sucrose phosphate synthase  36.18 
 
 
714 aa  421  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0227  sucrose-phosphate synthase  36.08 
 
 
784 aa  415  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2689  sucrose-phosphate synthase  33.69 
 
 
707 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.288748  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0143  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.63 
 
 
684 aa  372  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279801  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0200  HAD family hydrolase  34.66 
 
 
684 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21951  sucrose phosphate synthase  32.72 
 
 
702 aa  365  2e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.269726  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2315  sucrose-phosphate synthase  32.7 
 
 
709 aa  360  5e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1322  sucrose-phosphate synthase  31.85 
 
 
708 aa  358  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.435001  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30171  sucrose phosphate synthase  33.11 
 
 
707 aa  355  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1803  sucrose-phosphate synthase  40.71 
 
 
469 aa  350  4e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.69 
 
 
688 aa  348  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.533678  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19021  sucrose phosphate synthase  41.15 
 
 
470 aa  348  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.756574  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19201  sucrose phosphate synthase  40.04 
 
 
469 aa  343  5e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.8791  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19011  sucrose phosphate synthase  40.49 
 
 
469 aa  343  8e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.799465  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18491  sucrose phosphate synthase  37.44 
 
 
466 aa  296  9e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.179299 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18210  Sucrose-phosphate synthase  30.44 
 
 
496 aa  211  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.338675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1867  sucrose-phosphate synthase  29.51 
 
 
472 aa  179  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1752  Sucrose synthase  30.73 
 
 
806 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353077  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0177  Sucrose synthase  31.35 
 
 
792 aa  173  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3776  Sucrose synthase  29.48 
 
 
805 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2266  sucrose synthase  28.95 
 
 
794 aa  163  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.856509  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0446  sucrose-phosphate synthase  29.69 
 
 
479 aa  160  8e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2283  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
806 aa  160  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.356959  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1552  sucrose synthase, putative  28.6 
 
 
814 aa  158  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1268  Sucrose synthase  28.6 
 
 
793 aa  158  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209481  normal  0.340227 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3068  sucrose synthase  27 
 
 
795 aa  152  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3753  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
805 aa  150  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.115007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3916  Sucrose synthase  28.16 
 
 
803 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.067328 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0533  sucrose synthase  27.5 
 
 
423 aa  139  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0215  sucrose synthase  26.37 
 
 
809 aa  128  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413159  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
448 aa  127  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
425 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4476  sucrose phosphatase  33.47 
 
 
249 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4592  sucrose phosphatase  33.87 
 
 
252 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
435 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 
422 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  25.28 
 
 
423 aa  112  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 
424 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2470  sucrose phosphatase  35.08 
 
 
252 aa  107  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  25.57 
 
 
442 aa  106  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2821  sucrose-phosphate phosphatase  32.79 
 
 
249 aa  104  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.498458 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  25.45 
 
 
426 aa  103  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
439 aa  102  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 
439 aa  102  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 
439 aa  102  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  24.82 
 
 
650 aa  102  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 
426 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  25.05 
 
 
419 aa  99.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 
438 aa  98.6  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 
438 aa  97.8  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
438 aa  96.3  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 
672 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
402 aa  92  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
434 aa  91.3  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  23.17 
 
 
422 aa  90.9  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  24.89 
 
 
419 aa  90.9  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2718  HAD family hydrolase  31.34 
 
 
371 aa  90.9  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.65 
 
 
443 aa  89  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.65 
 
 
443 aa  89  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
477 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.65 
 
 
498 aa  88.2  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.08 
 
 
277 aa  88.2  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.65 
 
 
443 aa  87.4  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
406 aa  87.4  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.65 
 
 
499 aa  87.4  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.65 
 
 
443 aa  87.4  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.65 
 
 
495 aa  87.4  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
437 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  25.53 
 
 
406 aa  87.4  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
437 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
430 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
420 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  25.17 
 
 
403 aa  81.3  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  23.34 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3831  sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  26.12 
 
 
259 aa  80.5  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.678629  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1795  HAD family hydrolase  27.88 
 
 
276 aa  80.1  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000232683  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  29.92 
 
 
698 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 
434 aa  78.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3120  glucosylglycerol-phosphate synthase  29.39 
 
 
752 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361992  normal  0.0244373 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
405 aa  77.4  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
482 aa  77.8  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 
423 aa  76.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.88 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
448 aa  75.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>