More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1322 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1322  sucrose-phosphate synthase  100 
 
 
708 aa  1454    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.435001  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2315  sucrose-phosphate synthase  60.09 
 
 
709 aa  858    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2689  sucrose-phosphate synthase  59.21 
 
 
707 aa  866    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.288748  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21951  sucrose phosphate synthase  92.88 
 
 
702 aa  1349    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.269726  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30171  sucrose phosphate synthase  66.38 
 
 
707 aa  947    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18491  sucrose phosphate synthase  68.26 
 
 
466 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.179299 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0808  HAD family hydrolase  41.76 
 
 
709 aa  580  1e-164  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19021  sucrose phosphate synthase  59.33 
 
 
470 aa  571  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.756574  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19011  sucrose phosphate synthase  59.42 
 
 
469 aa  568  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.799465  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1803  sucrose-phosphate synthase  59.5 
 
 
469 aa  561  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19201  sucrose phosphate synthase  58.74 
 
 
469 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.8791  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2267  sucrose-phosphate phosphatase  42.11 
 
 
721 aa  552  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3069  HAD family hydrolase  40.79 
 
 
720 aa  547  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2312  sucrose-phosphate synthase  41.38 
 
 
723 aa  542  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.407263 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2610  sucrose-phosphate synthase, glycosyltransferase region  40.76 
 
 
725 aa  528  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2912  sucrose-phosphate synthase  39.83 
 
 
718 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0708  sucrose-phosphate synthase  39.07 
 
 
722 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1794  sucrose-phosphate synthase  39.53 
 
 
724 aa  509  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399032  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3516  sucrose-phosphate synthase  38.79 
 
 
716 aa  504  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1267  sucrose-phosphate synthase  38.68 
 
 
714 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.327347 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0650  sucrose-phosphate synthase  36.69 
 
 
735 aa  481  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238518  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1551  sucrose phosphate synthase  38.68 
 
 
714 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0227  sucrose-phosphate synthase  38 
 
 
784 aa  456  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3967  sucrose-phosphate phosphatase subfamily protein  34.48 
 
 
729 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0143  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.89 
 
 
684 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279801  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0200  HAD family hydrolase  33.71 
 
 
684 aa  360  4e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.05 
 
 
688 aa  355  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.533678  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3683  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.99 
 
 
762 aa  356  1e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0446  sucrose-phosphate synthase  32.19 
 
 
479 aa  237  5.0000000000000005e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18210  Sucrose-phosphate synthase  31.95 
 
 
496 aa  225  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.338675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1867  sucrose-phosphate synthase  31.17 
 
 
472 aa  210  6e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0533  sucrose synthase  29.27 
 
 
423 aa  187  7e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2283  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
806 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.356959  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3776  Sucrose synthase  29.53 
 
 
805 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1752  Sucrose synthase  29.03 
 
 
806 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353077  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1268  Sucrose synthase  27.11 
 
 
793 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209481  normal  0.340227 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1552  sucrose synthase, putative  27.11 
 
 
814 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2266  sucrose synthase  27.52 
 
 
794 aa  147  8.000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.856509  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3916  Sucrose synthase  28.43 
 
 
803 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.067328 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0177  Sucrose synthase  27.96 
 
 
792 aa  141  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3753  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 
805 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.115007 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0215  sucrose synthase  26.63 
 
 
809 aa  137  7.000000000000001e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413159  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3068  sucrose synthase  25.74 
 
 
795 aa  135  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
424 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
438 aa  124  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
448 aa  121  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 
438 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
439 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
438 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
439 aa  119  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
439 aa  119  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
430 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  26.44 
 
 
650 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
435 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
422 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.16 
 
 
423 aa  113  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 
419 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
434 aa  111  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
434 aa  109  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 
440 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
426 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  25.99 
 
 
442 aa  107  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
448 aa  107  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
482 aa  107  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.81 
 
 
443 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.81 
 
 
443 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.81 
 
 
498 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.1 
 
 
443 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
419 aa  106  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.27 
 
 
499 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.1 
 
 
443 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.27 
 
 
495 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 
422 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
672 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 
425 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 
421 aa  102  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  29.78 
 
 
403 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  28.64 
 
 
417 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  26.17 
 
 
417 aa  99.8  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
421 aa  98.2  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
477 aa  97.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  26.08 
 
 
443 aa  96.3  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  27.83 
 
 
450 aa  95.9  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
422 aa  94.4  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
402 aa  94  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.87 
 
 
405 aa  93.2  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  28.05 
 
 
466 aa  93.2  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  27.23 
 
 
431 aa  93.2  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  26.81 
 
 
406 aa  92.8  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
423 aa  91.3  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 
458 aa  91.7  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  27.54 
 
 
427 aa  91.3  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4476  sucrose phosphatase  26.21 
 
 
249 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
406 aa  89.7  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 
405 aa  89  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  28.33 
 
 
420 aa  88.6  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
420 aa  89  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  25.92 
 
 
458 aa  87.8  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
437 aa  87.8  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>