More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0533 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0533  sucrose synthase  100 
 
 
423 aa  865    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0446  sucrose-phosphate synthase  50.79 
 
 
479 aa  387  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18210  Sucrose-phosphate synthase  47.88 
 
 
496 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.338675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1867  sucrose-phosphate synthase  47.23 
 
 
472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2912  sucrose-phosphate synthase  31.18 
 
 
718 aa  199  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3516  sucrose-phosphate synthase  29.56 
 
 
716 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2610  sucrose-phosphate synthase, glycosyltransferase region  30.75 
 
 
725 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1794  sucrose-phosphate synthase  33.11 
 
 
724 aa  190  4e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399032  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2689  sucrose-phosphate synthase  27.87 
 
 
707 aa  189  5.999999999999999e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.288748  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0650  sucrose-phosphate synthase  30.94 
 
 
735 aa  188  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238518  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21951  sucrose phosphate synthase  29.36 
 
 
702 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.269726  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30171  sucrose phosphate synthase  28.64 
 
 
707 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1322  sucrose-phosphate synthase  29.27 
 
 
708 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.435001  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0227  sucrose-phosphate synthase  29.89 
 
 
784 aa  184  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18491  sucrose phosphate synthase  30.57 
 
 
466 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.179299 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2315  sucrose-phosphate synthase  27.79 
 
 
709 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3069  HAD family hydrolase  28.38 
 
 
720 aa  179  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2312  sucrose-phosphate synthase  29.1 
 
 
723 aa  179  7e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.407263 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2267  sucrose-phosphate phosphatase  28.54 
 
 
721 aa  179  9e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19201  sucrose phosphate synthase  31.4 
 
 
469 aa  179  9e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.8791  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19011  sucrose phosphate synthase  31.45 
 
 
469 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.799465  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0708  sucrose-phosphate synthase  29.95 
 
 
722 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1803  sucrose-phosphate synthase  30.82 
 
 
469 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0808  HAD family hydrolase  30.02 
 
 
709 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19021  sucrose phosphate synthase  30.6 
 
 
470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.756574  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1267  sucrose-phosphate synthase  27.8 
 
 
714 aa  161  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.327347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1551  sucrose phosphate synthase  27.8 
 
 
714 aa  161  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3967  sucrose-phosphate phosphatase subfamily protein  29.27 
 
 
729 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 
405 aa  145  9e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1752  Sucrose synthase  26.32 
 
 
806 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353077  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.52 
 
 
405 aa  143  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0177  Sucrose synthase  24.39 
 
 
792 aa  142  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3683  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.5 
 
 
762 aa  140  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3068  sucrose synthase  26.42 
 
 
795 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 
448 aa  136  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2283  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
806 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.356959  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
426 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
435 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
421 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 
421 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
422 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
434 aa  123  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1552  sucrose synthase, putative  25.89 
 
 
814 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1268  Sucrose synthase  25.85 
 
 
793 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209481  normal  0.340227 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2266  sucrose synthase  24.14 
 
 
794 aa  121  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.856509  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
419 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3776  Sucrose synthase  25.58 
 
 
805 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
440 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  26.68 
 
 
425 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.5 
 
 
423 aa  117  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 
426 aa  116  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  24.14 
 
 
403 aa  116  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
453 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3753  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  23.03 
 
 
805 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.115007 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  26.81 
 
 
650 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
672 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
423 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3916  Sucrose synthase  24.55 
 
 
803 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.067328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  24.57 
 
 
417 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
439 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
439 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0215  sucrose synthase  26.45 
 
 
809 aa  106  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413159  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
438 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 
438 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 
458 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
439 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  25.8 
 
 
417 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.46 
 
 
443 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.46 
 
 
498 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.46 
 
 
443 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.46 
 
 
495 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.46 
 
 
499 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
477 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.46 
 
 
443 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.46 
 
 
443 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
448 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  23.8 
 
 
424 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
422 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  23.74 
 
 
420 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 
422 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  23.04 
 
 
427 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  24.18 
 
 
442 aa  100  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
434 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  22.77 
 
 
431 aa  100  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  24.13 
 
 
413 aa  99.8  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  23.41 
 
 
443 aa  99.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  23.16 
 
 
406 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 
430 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  24.11 
 
 
407 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  25.69 
 
 
480 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  25.15 
 
 
397 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  24.07 
 
 
458 aa  98.2  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
438 aa  98.2  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  25.81 
 
 
450 aa  96.7  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 
415 aa  96.7  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  25.49 
 
 
420 aa  94.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4103  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
400 aa  94.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.355354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>