More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2912 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_3069  HAD family hydrolase  50.21 
 
 
720 aa  722    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1794  sucrose-phosphate synthase  57.08 
 
 
724 aa  833    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399032  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2267  sucrose-phosphate phosphatase  49.72 
 
 
721 aa  687    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0708  sucrose-phosphate synthase  52.03 
 
 
722 aa  738    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2610  sucrose-phosphate synthase, glycosyltransferase region  47.19 
 
 
725 aa  664    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3516  sucrose-phosphate synthase  60 
 
 
716 aa  895    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2312  sucrose-phosphate synthase  51.74 
 
 
723 aa  741    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.407263 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2912  sucrose-phosphate synthase  100 
 
 
718 aa  1472    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0227  sucrose-phosphate synthase  48.88 
 
 
784 aa  643    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0808  HAD family hydrolase  44.57 
 
 
709 aa  614  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1551  sucrose phosphate synthase  45.7 
 
 
714 aa  598  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0650  sucrose-phosphate synthase  44.66 
 
 
735 aa  596  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238518  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1267  sucrose-phosphate synthase  45.7 
 
 
714 aa  598  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.327347 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2689  sucrose-phosphate synthase  42.67 
 
 
707 aa  523  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.288748  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1322  sucrose-phosphate synthase  39.83 
 
 
708 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.435001  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21951  sucrose phosphate synthase  39.94 
 
 
702 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.269726  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30171  sucrose phosphate synthase  42.05 
 
 
707 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2315  sucrose-phosphate synthase  40.92 
 
 
709 aa  499  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3967  sucrose-phosphate phosphatase subfamily protein  39.39 
 
 
729 aa  496  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3683  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.77 
 
 
762 aa  459  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0143  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.23 
 
 
684 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279801  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0200  HAD family hydrolase  38.23 
 
 
684 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.95 
 
 
688 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.533678  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19011  sucrose phosphate synthase  44.88 
 
 
469 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.799465  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1803  sucrose-phosphate synthase  44.11 
 
 
469 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19201  sucrose phosphate synthase  45.35 
 
 
469 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.8791  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18491  sucrose phosphate synthase  47.88 
 
 
466 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.179299 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19021  sucrose phosphate synthase  43.05 
 
 
470 aa  398  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.756574  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18210  Sucrose-phosphate synthase  32.5 
 
 
496 aa  224  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.338675  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0446  sucrose-phosphate synthase  32.18 
 
 
479 aa  224  3e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1867  sucrose-phosphate synthase  31.55 
 
 
472 aa  220  7.999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0533  sucrose synthase  31.18 
 
 
423 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3776  Sucrose synthase  28.8 
 
 
805 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1268  Sucrose synthase  28.6 
 
 
793 aa  178  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209481  normal  0.340227 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1552  sucrose synthase, putative  28.6 
 
 
814 aa  178  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1752  Sucrose synthase  28.74 
 
 
806 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353077  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0177  Sucrose synthase  30 
 
 
792 aa  172  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3068  sucrose synthase  28.98 
 
 
795 aa  169  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2283  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
806 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.356959  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2266  sucrose synthase  27.96 
 
 
794 aa  167  8e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.856509  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3753  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 
805 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.115007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
453 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3916  Sucrose synthase  27.07 
 
 
803 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.067328 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0215  sucrose synthase  26.37 
 
 
809 aa  148  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413159  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
424 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
448 aa  140  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
419 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  26.76 
 
 
650 aa  128  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
434 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 
425 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
438 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
448 aa  119  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
423 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
422 aa  117  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
440 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
477 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  27.85 
 
 
423 aa  115  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 
405 aa  114  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
435 aa  114  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  27.68 
 
 
442 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 
438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
426 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 
439 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 
439 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 
439 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
448 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
402 aa  110  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
419 aa  110  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
422 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  28.23 
 
 
450 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  25.89 
 
 
443 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
420 aa  109  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
482 aa  109  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  28.96 
 
 
417 aa  108  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
458 aa  107  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
421 aa  107  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
430 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 
421 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
426 aa  106  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.13 
 
 
498 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.09 
 
 
443 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
672 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.09 
 
 
443 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
434 aa  105  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  27.62 
 
 
427 aa  105  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
437 aa  104  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
437 aa  104  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
405 aa  103  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.91 
 
 
499 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.91 
 
 
495 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
406 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.79 
 
 
443 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  27.27 
 
 
406 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.79 
 
 
443 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  28.3 
 
 
424 aa  102  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  28.91 
 
 
431 aa  102  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  28.87 
 
 
417 aa  100  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  28.09 
 
 
420 aa  100  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.74 
 
 
435 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>