More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0143 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0143  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 
684 aa  1365    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279801  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  86.7 
 
 
688 aa  1135    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.533678  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0200  HAD family hydrolase  98.1 
 
 
684 aa  1340    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2267  sucrose-phosphate phosphatase  42.48 
 
 
721 aa  501  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2312  sucrose-phosphate synthase  42.45 
 
 
723 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.407263 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3516  sucrose-phosphate synthase  39.43 
 
 
716 aa  477  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3069  HAD family hydrolase  38.52 
 
 
720 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0708  sucrose-phosphate synthase  39.89 
 
 
722 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2912  sucrose-phosphate synthase  38.37 
 
 
718 aa  462  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2610  sucrose-phosphate synthase, glycosyltransferase region  37.52 
 
 
725 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0808  HAD family hydrolase  37.17 
 
 
709 aa  453  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1794  sucrose-phosphate synthase  37.98 
 
 
724 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399032  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1551  sucrose phosphate synthase  38.9 
 
 
714 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1267  sucrose-phosphate synthase  38.9 
 
 
714 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.327347 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0650  sucrose-phosphate synthase  36.34 
 
 
735 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238518  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3967  sucrose-phosphate phosphatase subfamily protein  32.91 
 
 
729 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1322  sucrose-phosphate synthase  33.89 
 
 
708 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.435001  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3683  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.8 
 
 
762 aa  391  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21951  sucrose phosphate synthase  34.17 
 
 
702 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.269726  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2315  sucrose-phosphate synthase  35.82 
 
 
709 aa  373  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2689  sucrose-phosphate synthase  35.88 
 
 
707 aa  372  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.288748  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30171  sucrose phosphate synthase  36.7 
 
 
707 aa  372  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0227  sucrose-phosphate synthase  34.52 
 
 
784 aa  364  3e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19201  sucrose phosphate synthase  36.78 
 
 
469 aa  310  5e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.8791  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19011  sucrose phosphate synthase  36.32 
 
 
469 aa  306  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.799465  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1803  sucrose-phosphate synthase  35.86 
 
 
469 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19021  sucrose phosphate synthase  36.34 
 
 
470 aa  298  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.756574  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18491  sucrose phosphate synthase  41.01 
 
 
466 aa  293  7e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.179299 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18210  Sucrose-phosphate synthase  27.45 
 
 
496 aa  171  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.338675  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0446  sucrose-phosphate synthase  27.94 
 
 
479 aa  147  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1867  sucrose-phosphate synthase  27.37 
 
 
472 aa  143  9e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1752  Sucrose synthase  25.89 
 
 
806 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353077  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4592  sucrose phosphatase  33.87 
 
 
252 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1268  Sucrose synthase  28.83 
 
 
793 aa  133  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209481  normal  0.340227 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1552  sucrose synthase, putative  28.83 
 
 
814 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2283  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
806 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.356959  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4476  sucrose phosphatase  34.55 
 
 
249 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2266  sucrose synthase  27.2 
 
 
794 aa  125  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.856509  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1623  putative sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  30.29 
 
 
247 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0026077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3776  Sucrose synthase  25.85 
 
 
805 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0177  Sucrose synthase  27.73 
 
 
792 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.29 
 
 
443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.29 
 
 
443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.29 
 
 
498 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.43 
 
 
443 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.43 
 
 
499 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.43 
 
 
443 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.43 
 
 
495 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
448 aa  111  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3068  sucrose synthase  25.72 
 
 
795 aa  111  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 
482 aa  110  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0533  sucrose synthase  23.61 
 
 
423 aa  105  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  29.19 
 
 
424 aa  105  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3753  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  24.01 
 
 
805 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.115007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  34.66 
 
 
397 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  33.12 
 
 
443 aa  102  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2821  sucrose-phosphate phosphatase  31.17 
 
 
249 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.498458 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
439 aa  101  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
421 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
439 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
439 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3916  Sucrose synthase  24.88 
 
 
803 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.067328 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  25.92 
 
 
419 aa  99.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  26.91 
 
 
650 aa  99  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
435 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
424 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
458 aa  99.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
438 aa  99  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
420 aa  98.2  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
453 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  30.42 
 
 
466 aa  96.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
448 aa  96.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 
425 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  32.06 
 
 
450 aa  96.3  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  29.81 
 
 
406 aa  95.5  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
448 aa  95.1  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
422 aa  94.4  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 
438 aa  94.4  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  28.36 
 
 
417 aa  94  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
438 aa  93.6  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
426 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
421 aa  92  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
426 aa  92.4  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  30.85 
 
 
407 aa  91.7  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2470  sucrose phosphatase  30 
 
 
252 aa  91.7  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.38 
 
 
423 aa  91.7  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
434 aa  90.9  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  29.73 
 
 
428 aa  90.5  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
422 aa  90.1  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 
405 aa  90.1  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  31.03 
 
 
443 aa  89.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  25.92 
 
 
434 aa  88.6  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4824  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
712 aa  88.6  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.329742  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  29.2 
 
 
420 aa  88.6  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  29.36 
 
 
427 aa  88.2  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0215  sucrose synthase  24.44 
 
 
809 aa  88.6  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413159  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3515  HAD family hydrolase  32.21 
 
 
277 aa  88.2  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  28.13 
 
 
426 aa  88.2  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
406 aa  88.2  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  32.27 
 
 
403 aa  87.8  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>