More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0427 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0427  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
460 aa  954    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.049978  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3111  trehalose phosphorylase/synthase  41.35 
 
 
420 aa  296  5e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1359  glycosyl transferase, group 1  41.03 
 
 
402 aa  288  1e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.254886 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0594  glycosyl transferase, group 1  39.9 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2083  glycosyl transferase, group 1  41.58 
 
 
411 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1740  glycosyl transferase group 1  41.58 
 
 
411 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3082  glycosyl transferase, group 1  40.05 
 
 
474 aa  279  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0297  glycosyl transferase group 1  40.44 
 
 
411 aa  274  3e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0129  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
397 aa  272  7e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.730138  hitchhiker  0.000955625 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0797  glycosyl transferase, group 1  37.59 
 
 
408 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0528  glycosyl transferase, group 1  37.78 
 
 
406 aa  266  8e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000105595  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0542  glycosyl transferase group 1  37.72 
 
 
406 aa  264  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000128948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2348  glycosyl transferase, group 1  38.22 
 
 
411 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0363579  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1192  glycosyl transferase, group 1  38.26 
 
 
410 aa  262  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5908  glycosyl transferase group 1  36.89 
 
 
410 aa  257  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1592  glycosyl transferase, group 1  34.77 
 
 
414 aa  257  4e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2973  glycosyl transferase, group 1  37.29 
 
 
416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0419  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 
413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.102155  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1763  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
419 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.410209  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1718  glycosyl transferase group 1  36.27 
 
 
433 aa  250  5e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1812  glycosyl transferase, group 1  36.07 
 
 
407 aa  244  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0100815  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1821  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 
403 aa  244  3e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0709671  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3832  glycosyl transferase group 1  38.31 
 
 
417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672883  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0451  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
406 aa  233  6e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.340856  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2023  glycosyl transferase, group 1  35.21 
 
 
442 aa  228  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1550  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.267317  hitchhiker  0.0000000000000568319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4094  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
509 aa  160  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108712  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3637  glycosyl transferase group 1  28.6 
 
 
497 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.564588 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05021  trehalose synthase (Ccg-9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12100)  26.88 
 
 
705 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04480  trehalose synthase, putative  27.7 
 
 
734 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22554  mannosyltransferase  29.91 
 
 
419 aa  89.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.79 
 
 
381 aa  87  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.79 
 
 
381 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.93 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  30.93 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.93 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  30.93 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.93 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  30.93 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.41 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
381 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0650  sucrose-phosphate synthase  31.19 
 
 
735 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238518  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
672 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  47.44 
 
 
426 aa  77  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  33.83 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  36.04 
 
 
388 aa  76.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
406 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  28.1 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.32 
 
 
443 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.32 
 
 
443 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.32 
 
 
498 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  35.2 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  31.34 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  32.98 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.82 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
370 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.86 
 
 
443 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  39.81 
 
 
413 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  30.92 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  30.1 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.86 
 
 
499 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  29.91 
 
 
404 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.86 
 
 
443 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.86 
 
 
495 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  39.29 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  37.23 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  42.53 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  33.96 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3516  sucrose-phosphate synthase  29.61 
 
 
716 aa  69.7  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
424 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1794  sucrose-phosphate synthase  33.33 
 
 
724 aa  69.3  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399032  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  43.02 
 
 
403 aa  69.7  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0177  Sucrose synthase  28.08 
 
 
792 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  28.88 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  31.53 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
439 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
438 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  30.14 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  34.17 
 
 
468 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.46 
 
 
367 aa  67  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>