44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3836 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3977  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  86.64 
 
 
567 aa  717    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110914  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3899  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  87.21 
 
 
559 aa  691    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3836  HEAT repeat-containing protein  100 
 
 
533 aa  971    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3949  heat domain-containing protein  66.43 
 
 
569 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0775778 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  34.44 
 
 
1094 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.56 
 
 
395 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  50.45 
 
 
319 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  50.45 
 
 
323 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  33.59 
 
 
546 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.07 
 
 
510 aa  57  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  33.52 
 
 
299 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  32.56 
 
 
958 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.75 
 
 
214 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  46.83 
 
 
319 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.6 
 
 
1343 aa  54.3  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.27 
 
 
666 aa  54.3  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  29.52 
 
 
1224 aa  53.9  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.36 
 
 
399 aa  53.5  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  33.83 
 
 
643 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.26 
 
 
221 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.7 
 
 
377 aa  50.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  31 
 
 
1041 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.58 
 
 
1027 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1251  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.04 
 
 
162 aa  47.8  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  35.25 
 
 
325 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.61 
 
 
667 aa  47.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.43 
 
 
321 aa  47  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.25 
 
 
325 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  29.13 
 
 
959 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  28.96 
 
 
286 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1616  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.43 
 
 
375 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000382095  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  27.84 
 
 
493 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  34.86 
 
 
320 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  32.64 
 
 
381 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  35.88 
 
 
321 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1896  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.8 
 
 
298 aa  45.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.52 
 
 
642 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.82 
 
 
313 aa  44.3  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.37 
 
 
192 aa  43.9  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1460  HEAT domain containing protein  35.59 
 
 
165 aa  43.9  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0030107  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.43 
 
 
208 aa  43.9  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.92 
 
 
1412 aa  43.5  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.84 
 
 
157 aa  43.5  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  29.09 
 
 
1143 aa  43.5  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>