36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3977 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3899  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  93.65 
 
 		 559 aa  716    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3836  HEAT repeat-containing protein  87.65 
 
 		 533 aa  694    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3977  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 567 aa  1031    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3949  heat domain-containing protein  66.04 
 
 		 569 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0775778 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  35.75 
 
 		 1094 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  50.45 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  50.45 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.09 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.6 
 
 		 510 aa  57  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  32.81 
 
 		 546 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  46.83 
 
 		 319 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  34.59 
 
 		 643 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1224 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  32.4 
 
 		 958 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  33.33 
 
 		 299 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.3 
 
 		 214 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.03 
 
 		 208 aa  55.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.04 
 
 		 1343 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.78 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.7 
 
 		 377 aa  51.2  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.3 
 
 		 666 aa  50.8  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.06 
 
 		 221 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  34.53 
 
 		 493 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.34 
 
 		 1041 aa  47.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  35.25 
 
 		 325 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  35.21 
 
 		 321 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.61 
 
 		 321 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.43 
 
 		 1027 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.77 
 
 		 670 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1616  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.72 
 
 		 375 aa  45.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000382095  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1251  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.96 
 
 		 162 aa  45.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.05 
 
 		 1139 aa  45.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1460  HEAT domain containing protein  35.59 
 
 		 165 aa  45.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0030107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.05 
 
 		 667 aa  43.9  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.78 
 
 		 642 aa  43.9  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.79 
 
 		 192 aa  43.5  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>