138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3140 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 670 aa  1332    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  50.07 
 
 		 666 aa  624  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  50.9 
 
 		 667 aa  616  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  46.21 
 
 		 646 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  45.75 
 
 		 646 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.19 
 
 		 668 aa  360  5e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.23 
 
 		 1343 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1094 aa  134  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  25.89 
 
 		 958 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.79 
 
 		 641 aa  128  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  28.12 
 
 		 1148 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.89 
 
 		 642 aa  124  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.93 
 
 		 1438 aa  122  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.78 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.85 
 
 		 642 aa  111  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1224 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2732  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.59 
 
 		 690 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378578  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.5 
 
 		 232 aa  95.5  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.72 
 
 		 1181 aa  91.3  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  26.21 
 
 		 546 aa  89.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  23.46 
 
 		 959 aa  89  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.54 
 
 		 492 aa  88.6  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  36.2 
 
 		 643 aa  87.8  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  32.16 
 
 		 886 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  23.9 
 
 		 1328 aa  85.1  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2824  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.49 
 
 		 690 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126862  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2916  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.93 
 
 		 690 aa  84.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0883054  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.11 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  28.18 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  25.35 
 
 		 644 aa  80.5  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.43 
 
 		 1139 aa  75.9  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  25.3 
 
 		 838 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  24.6 
 
 		 428 aa  73.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.36 
 
 		 524 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.44 
 
 		 192 aa  71.6  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.73 
 
 		 490 aa  71.2  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  29.54 
 
 		 501 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.62 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 593 aa  67  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.68 
 
 		 1412 aa  67  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.72 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.74 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.12 
 
 		 370 aa  63.5  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.69 
 
 		 121 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.54 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  24.46 
 
 		 1133 aa  61.2  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.92 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.34 
 
 		 176 aa  59.3  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.03 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.96 
 
 		 1110 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  30.41 
 
 		 1216 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  27.8 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.54 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.99 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  35.33 
 
 		 773 aa  57.4  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0288  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.29 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  25.85 
 
 		 431 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.63 
 
 		 302 aa  56.6  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2520  sulfatase  35.71 
 
 		 607 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.541987  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  31.65 
 
 		 218 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1458  hypothetical protein  28.92 
 
 		 357 aa  56.2  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  31.07 
 
 		 199 aa  55.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.51 
 
 		 1041 aa  55.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2742  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 121 aa  55.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  25.08 
 
 		 402 aa  55.8  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.44 
 
 		 377 aa  55.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  25.5 
 
 		 319 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.97 
 
 		 831 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4077  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.06 
 
 		 515 aa  54.3  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.85 
 
 		 331 aa  53.5  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.27 
 
 		 221 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0286  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.36 
 
 		 545 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.18 
 
 		 325 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  31.21 
 
 		 320 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.11 
 
 		 323 aa  53.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0423  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.64 
 
 		 534 aa  52.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0642387  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.05 
 
 		 200 aa  53.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.62 
 
 		 331 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0241  diguanylate cyclase  23.25 
 
 		 450 aa  52.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4110  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.06 
 
 		 515 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0298438  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.27 
 
 		 220 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2934  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.88 
 
 		 276 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  31.85 
 
 		 325 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0425  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.74 
 
 		 197 aa  52.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3997  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.89 
 
 		 168 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  30.77 
 
 		 321 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.56 
 
 		 220 aa  51.6  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  21.5 
 
 		 1143 aa  51.6  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.65 
 
 		 180 aa  51.6  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.62 
 
 		 157 aa  51.6  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0133  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.74 
 
 		 197 aa  50.8  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000842725  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2324  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.79 
 
 		 182 aa  50.4  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.21 
 
 		 951 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  34.75 
 
 		 381 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  33.75 
 
 		 321 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  25.47 
 
 		 323 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.71 
 
 		 320 aa  50.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  28.38 
 
 		 319 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4092  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.27 
 
 		 178 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.95 
 
 		 212 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>